Surveillance for highly pathogenic H5 avian influenza virus in synanthropic wildlife associated with poultry farms during an acute outbreak
Notice bibliographique
Résumé
In November 2014, a Eurasian strain H5N8 highly pathogenic avian influenza virus was detected in poultry in Canada. Introduced viruses were soon detected in the United States and within six months had spread to 21 states with more than 48 million poultry affected. In an effort to study potential mechanisms of spread of the Eurasian H5 virus, the United States Department of Agriculture coordinated several epidemiologic investigations at poultry farms. As part of those efforts, we sampled synanthropic birds and mammals at five infected and five uninfected poultry farms in northwest Iowa for exposure to avian influenza viruses. Across all farms, we collected 2,627 samples from 648 individual birds and mammals. House mice were the most common mammal species captured while house sparrows, European starlings, rock pigeons, swallows, and American robins were the most commonly captured birds. A single European starling was positive for Eurasian H5 viral RNA and seropositive for antibodies reactive to the Eurasian H5 virus. Two American robins were also seropositive. No mammal species showed evidence of infection. These results indicate synanthropic species merit further scrutiny to better understand potential biosecurity risks. We propose a set of management practices aimed at reducing wildlife incursions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».