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Enregistrement W2549668171 · doi:10.1182/blood.v106.11.1378.1378

Dominant and Pharmacologically Sensitized ENU Mutagenesis Screens Uncover Novel Regulators of Hematopoiesis and Model Hematopoietic Disease.

2005· article· en· W2549668171 sur OpenAlexaff
William L. Stanford, Nicole Anderson, Zorana Milenkovic, Lia Zitano, Lee K. Adamson, Chen Wang, Myron I. Cybulsky, Kelly M. McNagny, Robert F. Paulson, Dwayne L. Barber, Mark D. Minden

Notice bibliographique

RevueBlood · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Myeloid Leukemia Research
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaOntario Institute for Cancer ResearchUniversity of TorontoMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyHaematopoiesisGenetic screenGeneticsMutationMutagenesisFrameshift mutationMutantGeneStem cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract To generate new mouse models of human hematopoietic disease and increase our knowledge of the genetic networks that control hematopoiesis, we are performing dominant (generation 1 or G1) and pharmacologically-sensitized forward ethylnitrososurea (ENU) mutagenesis screens. Mice are phenotyped by saphenous vein peripheral blood analysis using an automated hematological analyzer. ENU is ideally suited to generating models of human disease and annotating gene function because the spectrum of mutations (point mutations generating leading to subtle amino acid substitutions, splicing errors, or premature termination) are similar to those often found in human disease. Furthermore, null mutations often do not represent the full extent of a gene’s function, requiring multiple alleles to fully define gene function. While dominant mutations can unequivocally cause some human diseases, often mutations in multiple genes interact and contribute to disease progression. Thus, we have developed sensitized screens that induce transient cytopenias using various pharmacological agents (5-fluorouracil, phenylhydrazine, and hydroxyurea) and analyzing the recovery in peripheral blood levels of red blood cells, white blood cells and platelets. This strategy enables identification of hematopoietic mutants that do not present abnormal blood cell counts in a homeostatic state. The induced cytopenia recovery assay is also being used as a secondary phenotyping assay for some of our G1 dominant mutants. The combined dominant and sensitized screens have yielded 14 heritable dominant mutants to date plus four additional mutants in hereditary testing. The array of mutations that we are analyzing are models for the following diseases: polycythemia, thrombocythemia, leukocytosis, anemia, and thrombocytopenia. I will discuss the progress of the mutagenesis screen and several ENU mutants, including a novel mutation in the protein tyrosine kinase Jak2, leading to thrombocythemia. This point mutation in the protein kinase domain will help us to dissect the recently discovered role of Jak2 in Myeloproliferative Diseases including Essential Thrombocythemia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,278
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2005
Routes d'admission1
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