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Enregistrement W2549842750 · doi:10.12688/f1000research.9918.1

Evaluation of recombinant monoclonal antibody SVmab1 binding to NaV1.7 target sequences and block of human NaV1.7 currents

2016· preprint· en· W2549842750 sur OpenAlexaff
Dong Liu, Mandy Tseng, Linda F. Epstein, Lydia Green, Brian Chan, Brian D. Soriano, Désirée Lim, Oscar Pan, Christopher M. Murawsky, Chadwick King, Bryan D. Moyer

Notice bibliographique

RevueF1000Research · 2016
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensAmgen (Canada)
Organismes subventionnairesFogarty International CenterAmgen
Mots-clésBiologyRecombinant DNAMonoclonal antibodyAntibodyBiochemistryGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<ns4:p> Identification of small and large molecule pain therapeutics that target the genetically validated voltage-gated sodium channel Na <ns4:sub>V</ns4:sub> 1.7 is a challenging endeavor under vigorous pursuit. The monoclonal antibody SVmab1 was recently published to bind the Na <ns4:sub>V</ns4:sub> 1.7 DII voltage sensor domain and block human Na <ns4:sub>V</ns4:sub> 1.7 sodium currents in heterologous cells. We produced purified SVmab1 protein based on publically available sequence information, and evaluated its activity in a battery of binding and functional assays. Herein, we report that our recombinant SVmAb1 does not bind peptide immunogen or purified Na <ns4:sub>V</ns4:sub> 1.7 DII voltage sensor domain via ELISA, and does not bind Na <ns4:sub>V</ns4:sub> 1.7 in live HEK293, U-2 OS, and CHO-K1 cells via FACS. Whole cell manual patch clamp electrophysiology protocols interrogating diverse Na <ns4:sub>V</ns4:sub> 1.7 gating states in HEK293 cells, revealed that recombinant SVmab1 does not block Na <ns4:sub>V</ns4:sub> 1.7 currents to an extent greater than observed with an isotype matched control antibody. Collectively, our results show that recombinant SVmab1 monoclonal antibody does not bind Na <ns4:sub>V</ns4:sub> 1.7 target sequences or specifically inhibit Na <ns4:sub>V</ns4:sub> 1.7 current. </ns4:p>

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,656

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,095
Tête enseignante GPT0,426
Écart entre enseignants0,331 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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