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Enregistrement W2549985624 · doi:10.71781/26146

Étude du rôle biologique de l'activateur de phosphatase Rrd 1 chez la levure Saccharomyces cerevisiae

2006· dissertation· fr· W2549985624 sur OpenAlexfundno aff
Julie Douville

Notice bibliographique

RevuePapyrus : Institutional Repository (Université de Montréal) · 2006
Typedissertation
Languefr
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrobial Metabolism and Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesFonds de Recherche du Québec - SantéCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMolecular biologyChemistrySaccharomyces cerevisiaeBiologyYeastBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Le stress oxidatif généré par l'environnement autant que par la cellule ellemême est délétère pour certains constituants cellulaires essentiels tels l'ADN, l'ARN, les protéines et les lipides et a par conséquent un impact considérable sur la survie cellulaire.Notre laboratoire s'est intéressé à Rrdl, un activateur de phosphatase qui joue un rôle essentiel dans la protection de la cellule contre ce type de stress.En effet, une cellule mutante pour le gène RRDJ est hypersensible à des agents causant du stress oxidatif, comme les UVA et le 4-nitroquinoline-l-oxide.Ces mutants présentent un autre phénotype intéressant, soit une résistance considérable à la rapamycine, un immunosuppresseur qui mime des conditions de carence nutritionnelle.Les travaux présentés dans cette thèse montrent que Rrdl interagit avec une phosphatase, Sit4, pour protéger la cellule contre les dommages à l'ADN induits par le stress oxidatif.Cette interaction pourrait permettre l'expression de gènes critiques pour la réparation de ce type de dommages.Nos travaux démontrent également qu'une souche mutante pour RRDJ présente un défaut dans la régulation de la transcription in vivo en réponse à un traitement à la rapamycine, et des extraits nucléaires dérivés de cette souche sont déficients pour l'activation de la transcription in vitro d'un gène rapporteur.De plus, nous montrons que la rapamycine provoque la dégradation de Rpb 1, la grosse sous unité de l'ARN polymérase II.Ce phénomène est réduit de façon dramatique dans Iv les cellules rrd]z\, suggérant que la transcription se poursuit chez les mutants, permettant la croissance malgré le traitement à la raparnycine.Nos travaux suggèrent aussi un autre rôle prédominant dans la cellule pour Rrdl.En effet, Rrd lest associé avec la machinerie transcriptioirnelle, de même qu'avec l'ARN polyrnérase II.Nous démontrons que les mutants rrd]A sont incapables de dégrader l'ARN polymérase II en réponse au 4-nitroquinoline-l-oxide en plus de la rapamycine.Les mutants montrent une accumulation de la forme ubiquitinée de Rpbl, et cette accumulation est causée par l'incapacité des mutants à déloger l'ARN polymérase II de la chrornatine en réponse à un arrêt de la transcription induit par ces deux agents.De plus, nous montrons qu'en réponse à ces agents, il n'y a pas de changement dans la conformation du domaine C-terminal de l'ARN polymérase II dans les mutants contrairement à ce qu'on observe dans la souche sauvage.L'ensemble de nos résultats suggèrent que Rrdl est requis pour isomériser le domaine C-terminal de l'ARN polymérase afin de permettre sa dégradation via le protéasorne lorsque l'élongation de la transcription est arrêtée.En plus de caractériser un rôle tout à fait novateur pour Rrdl, nos observations présentent la première démonstration que le domaine C-terminal de l'ARN polyrnérase est isomérisé in vivo, en plus d'associer une fonction à ce changement de structure.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Autre · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,034

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,173
Écart entre enseignants0,170 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreAutre

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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