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Enregistrement W2550028823 · doi:10.1038/srep36826

Novel High-throughput Approach for Purification of Infectious Virions

2016· article· en· W2550028823 sur OpenAlexafffund
Kevin T. James, Brad Cooney, Kate Agopsowicz, Mary Ann Trevors, Adil Mohamed, Don Stoltz, Mary Hitt, Maya Shmulevitz

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral gastroenteritis research and epidemiology
Établissements canadiensDalhousie UniversityUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanada Research ChairsUniversity of Alberta
Mots-clésThroughputVirologyComputer scienceComputational biologyBiologyTelecommunications

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Viruses are extensively studied as pathogens and exploited as molecular tools and therapeutic agents. Existing methods to purify viruses such as gradient ultracentrifugation or chromatography have limitations, for example demand for technical expertise or specialized equipment, high time consumption, and restricted capacity. Our laboratory explores mutations in oncolytic reovirus that could improve oncolytic activity, and makes routine use of numerous virus variants, genome reassortants, and reverse engineered mutants. Our research pace was limited by the lack of high-throughput virus purification methods that efficiently remove confounding cellular contaminants such as cytokines and proteases. To overcome this shortcoming, we evaluated a commercially available resin (Capto Core 700) that captures molecules smaller than 700 kDa. Capto. Core 700 chromatography produced virion purity and infectivity indistinguishable from CsCl density gradient ultracentrifugation as determined by electron microscopy, gel electrophoresis analysis and plaque titration. Capto Core 700 resin was then effectively adapted to a rapid in-slurry pull-out approach for high-throughput purification of reovirus and adenovirus. The in-slurry purification approach offered substantially increased virus purity over crude cell lysates, media, or high-spin preparations and would be especially useful for high-throughput virus screening applications where density gradient ultracentrifugation is not feasible.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,321
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations74
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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