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Enregistrement W2550109145 · doi:10.1016/j.neurobiolaging.2016.11.010

ATXN2 trinucleotide repeat length correlates with risk of ALS

2016· review· nl· W2550109145 sur OpenAlexaff
William Sproviero, Aleksey Shatunov, Daniel Ståhl, Maryam Shoai, Wouter van Rheenen, Safa Al‐Sarraj, Peter M. Andersen, Nancy M. Bonini, F. L. Conforti, Philip Van Damme, Hussein Daoud, Maria del Mar Amador, Isabella Fogh, Monica Forzan, Ben Gaastra, Cinzia Gellera, Aaron D. Gitler, John Hardy, Pietro Fratta, Vincenzo La Bella, Isabelle Le Ber, Tim Van Langenhove, Serena Lattante, Yi‐Chung Lee, Andrea Malaspina, Vincent Meininger, Stéphanie Millecamps, Richard W. Orrell, Rosa Rademakers, Wim Robberecht, Guy A. Rouleau, Owen A. Ross, François Salachas, Katie Sidle, Bradley Smith, Bing‐Wen Soong, Gianni Sorarú, Giovanni Stévanin, Edor Kabashi, Claire Troakes, Christine Van Broeckhoven, Jan H. Veldink, Leonard H. van den Berg, Christopher E. Shaw, John Powell, Ammar Al‐Chalabi

Notice bibliographique

RevueNeurobiology of Aging · 2016
Typereview
Languenl
DomaineMedicine
ThématiqueAmyotrophic Lateral Sclerosis Research
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesFonds Wetenschappelijk OnderzoekMedical Research CouncilBelgian Federal Science Policy OfficeKing's College LondonVlaamse regeringSouth London and Maudsley NHS Foundation TrustMotor Neurone Disease AssociationUniversiteit AntwerpenNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute for Health and Care ResearchAssociation pour la Recherche sur la Sclérose Latérale Amyotrophique et autres Maladies du MotoneuroneWellcome Trust
Mots-clésTrinucleotide repeat expansionAmyotrophic lateral sclerosisAlleleOdds ratioGeneticsBiologyConfidence intervalMedicineDiseaseInternal medicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We investigated a CAG trinucleotide repeat expansion in the ATXN2 gene in amyotrophic lateral sclerosis (ALS). Two new case-control studies, a British dataset of 1474 ALS cases and 567 controls, and a Dutch dataset of 1328 ALS cases and 691 controls were analyzed. In addition, to increase power, we systematically searched PubMed for case-control studies published after 1 August 2010 that investigated the association between ATXN2 intermediate repeats and ALS. We conducted a meta-analysis of the new and existing studies for the relative risks of ATXN2 intermediate repeat alleles of between 24 and 34 CAG trinucleotide repeats and ALS. There was an overall increased risk of ALS for those carrying intermediate sized trinucleotide repeat alleles (odds ratio 3.06 [95% confidence interval 2.37–3.94]; p = 6 × 10−18), with an exponential relationship between repeat length and ALS risk for alleles of 29–32 repeats (R2 = 0.91, p = 0.0002). No relationship was seen for repeat length and age of onset or survival. In contrast to trinucleotide repeat diseases, intermediate ATXN2 trinucleotide repeat expansion in ALS does not predict age of onset but does predict disease risk.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,688
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,278 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations130
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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