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Enregistrement W2550485756 · doi:10.1182/blood.v104.11.4148.4148

Induction of Transient Cytopenia to Detect Hematopoietic Defects in the Mouse.

2004· article· en· W2550485756 sur OpenAlexaff
Nicole Anderson, Lee K. Adamson, Dwayne L. Barber, William L. Stanford

Notice bibliographique

RevueBlood · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Myeloid Leukemia Research
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyPhenotypeGeneticsPenetranceCytopeniaHaematopoiesisGenetic screenMutantImmunologyGeneBone marrowStem cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract In an attempt to generate new mouse models of human hematopoietic diseases and increase our knowledge of the genetic networks that orchestrate hematopoiesis, we are developing a sensitized screen that will more effectively identify hematopoietic in heterozygous mutants. The chemical mutagen ethylnitrososurea (ENU) is a highly efficient mutagen in the mouse and other model organisms, generating primarily point mutations. As a part of the Centre for Modeling Human Disease (CMHD), we have used simple clinical assays such as blood morphology and automated blood cell counts to test saphenous vein collected peripheral blood from approximately 6500 offspring of ENU mutagenized mice to identify clinically relevant dominantly inherited hematopoietic disease models. Phenodeviant G1 animals are bred to wild type mice to generate G2 mice, and G2 strains demonstrating high penetrance undergo a genome scan. This strategy has yielded 14 heritable dominant mutants to date. However, many genes and pathways will not express phenotypes in a dominant manner due to the homeostatic balance maintained by complex genetic networks, possessing excess capacity or redundancy, a problem exacerbated by using a viable peripheral blood assay. For example, only one of the 14 heritable hematopoietic mutants demonstrates anemia. Because environmental sensitization can exacerbate latent phenotypes, such as the effect of a high salt diet in an individual with prehypertension, sensitized screens should identify subtle and additional phenotypes of dominant mutations. Thus, we are developing a sensitized screen to uncover subtle dominant phenotypes by inducing transient cytopenia and following the kinetics and magnitude of the recovery. We are using a variety of drugs (5-fluorouracil, phenylhydrazine, and hydroxyurea) to induce cytopenia and recruit hematopoietic stem cells and progenitors to repopulate the blood with differentiated cells. We hypothesize that animals with defects in blood development will demonstrate altered recovery kinetics. This strategy will allow us to determine if there is a defect in blood cell progenitors, while keeping the animals viable for further screening and breeding. We are testing these drugs on known dominant and recessive mutants to validate the assay, determine the best dosages, and compare the effects of each drug. However, we have already begun to use 5-fluoruracil on a cohort of G1 animals and have identified two G1s that display latent recovery in at least 1 blood lineage. The two G1s are confirmed heritable and are currently undergoing a genome scan to map position the mutation. We believe this strategy will further our understanding of the molecular mechanisms that regulate hematopoietic development, as well as generate new mouse models of human hematopoietic diseases and identify the underlying molecular defects of diseases whose etiological origins are currently unknown.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0020,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2004
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