MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2550775347 · doi:10.1002/mnfr.201600596

Time‐ and strain‐specific downregulation of intestinal <i>EPAS1</i> via miR‐148a by <i>Bifidobacterium bifidum</i>

2016· article· en· W2550775347 sur OpenAlexafffund
Amel Taïbi, Natasha Singh, Jian‐Min Chen, Stefania Arioli, Simone Guglielmetti, Elena M. Comelli

Notice bibliographique

RevueMolecular Nutrition & Food Research · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensCentre for Global Health ResearchCanadian Nutrition SocietyUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of TorontoJames H. Cummings Foundation
Mots-clésBifidobacterium bifidumCecumDownregulation and upregulationBiologyBifidobacteriumProbioticMicrobiologyMolecular biologyLactobacillusFermentationBiochemistryBacteriaGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SCOPE: Bifidobacteria play a role in intestinal homeostasis but molecular mechanisms remain underinvestigated. The aim of this study was to assess if probiotic Bifidobacterium strains alter expression of intestinal microRNA and downstream target gene response. METHODS AND RESULTS: The expression of miR-148a and its validated target endothelial PAS domain protein 1 (EPAS1) was analyzed in Caco-2 cells and mice cecum in response to Bifidobacterium bifidum MIMBb75, B. bifidum NCC390, or Bifidobacterium longum NCC2705. In vitro, exposure to B. bifidum MIMBb75, but not to B. bifidum NCC390 or B. longum NCC2705, increased the expression of miR-148a after 1 and 4 h (p < 0.01), but not after 24 h. In vivo, B. bifidum MIMBb75 administration to C57BL/6J mice increased miR-148a expression in the cecum after 2 but not 14 days (p < 0.05). The increase in miR-148a was accompanied by a decrease in EPAS1 expression in Caco-2 cells and cecum (p < 0.05). Silencing of miR-148a reversed B. bifidum MIMBb75 dependent downregulation of EPAS1. CONCLUSION: This study shows an early response of intestinal cells to B. bifidum MIMBb75 through miR-148a modulation. This brings a new concept of strain- and time-dependent bifidobacteria-host crosstalk via microRNA. Probiotic B. bifidum MIMBb75 may help attenuating EPAS1 overexpression associated with intestinal inflammation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,254 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMolecular Nutrition & Food ResearchMême sujetMicroRNA in disease regulationTravaux en français237 207