MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2551075949 · doi:10.1111/tpj.13431

Engineering the expression level of cytosolic nucleoside diphosphate kinase in transgenic <i>Solanum tuberosum</i> roots alters growth, respiration and carbon metabolism

2016· article· en· W2551075949 sur OpenAlexafffund
Sonia Dorion, Audrey Clendenning, Jean Rivoal

Notice bibliographique

RevueThe Plant Journal · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMechanisms of cancer metastasis
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyBiochemistryNucleosidePopulationNucleoside-diphosphate kinaseEnzymeMetabolism

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Summary Nucleoside diphosphate kinase ( NDPK ) is a ubiquitous enzyme that catalyzes the transfer of the γ‐phosphate from a donor nucleoside triphosphate to an acceptor nucleoside diphosphate. In this study we used a targeted metabolomic approach and measurement of physiological parameters to report the effects of the genetic manipulation of cytosolic NDPK ( NDPK 1) expression on physiology and carbon metabolism in potato ( Solanum tuberosum ) roots. Sense and antisense NDPK 1 constructs were introduced in potato using Agrobacterium rhizogenes to generate a population of root clones displaying a 40‐fold difference in NDPK activity. Root growth, O 2 uptake, flux of carbon between sucrose and CO 2 , levels of reactive oxygen species and some tricarboxylic acid cycle intermediates were positively correlated with levels of NDPK 1 expression. In addition, NDPK 1 levels positively affected UDP ‐glucose and cellulose contents. The activation state of ADP ‐glucose pyrophosphorylase, a key enzyme in starch synthesis, was higher in antisense roots than in roots overexpressing NDPK 1. Further analyses demonstrated that ADP ‐glucose pyrophosphorylase was more oxidized, and therefore less active, in sense clones than antisense clones. Consequently, antisense NDPK 1 roots accumulated more starch and the starch to cellulose ratio was negatively affected by the level of NDPK 1. These data support the idea that modulation of NDPK 1 affects the distribution of carbon between starch and cellulose biosynthetic pathways.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,237

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe Plant JournalMême sujetMechanisms of cancer metastasisTravaux en français237 207