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Enregistrement W2551264639 · doi:10.1096/fj.201600914r

A novel amino acid and metabolomics signature in mice overexpressing muscle uncoupling protein 3

2016· article· en· W2551264639 sur OpenAlexafffund
Céline Aguer, Brian D. Piccolo, Oliver Fiehn, Sean H. Adams, Mary‐Ellen Harper

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdipose Tissue and Metabolism
Établissements canadiensMontfort HospitalUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchAgricultural Research ServiceNational Institutes of HealthHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésUCP3Skeletal muscleUncoupling proteinMetaboliteInternal medicineEndocrinologyBiochemistryMetabolomicsMetabolismChemistryAmino acidBiologyMedicineChromatographyAdipose tissue

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Uncoupling protein 3 (UCP3) is highly selectively expressed in skeletal muscle and is known to lower mitochondrial reactive oxygen species and promote fatty acid oxidation; however, the global impact of UCP3 activity on skeletal muscle and whole‐body metabolism have not been extensively studied. We utilized untargeted metabolomics to identify novel metabolites that distinguish mice overexpressing UCP3 in muscle, both at rest and after exercise regimens that challenged muscle metabolism, to potentially unmask subtle phenotypes. Male wild‐type (WT) and muscle‐specific UCP3‐overexpressing transgenic (UCP3 Tg) C57BL/6J mice were compared with or without a 5 wk endurance training protocol at rest or after an acute exercise bout (EB). Skeletal muscle, liver, and plasma samples were analyzed by gas chromatography time‐of‐flight mass spectrometry. Discriminant metabolites were considered if within the top 99th percentile of variable importance measurements obtained from partial least‐squares discriminant analysis models. A total of 80 metabolites accurately discriminated UCP3 Tg mice from WT when modeled within a specific exercise condition (i.e., untrained/rested, endurance trained/rested, untrained/EB, and endurance trained/EB). Results revealed that several amino acids and amino acid derivatives in skeletal muscle and plasma of UCP3 Tg mice ( e.g ., Asp, Glu, Lys, Tyr, Ser, Met) were significantly reduced after an EB; that metabolites associated with skeletal muscle glutathione/Met/Cys metabolism (2‐hydroxybutanoic acid, oxoproline, Gly, and Glu) were altered in UCP3 Tg mice across all training and exercise conditions; and that muscle metabolite indices of dehydrogenase activity were increased in UCP3 Tg mice, suggestive of a shift in tissue NADH/NAD + ratio. The results indicate that mitochondrial UCP3 activity affects metabolism well beyond fatty acid oxidation, regulating biochemical pathways associated with amino acid metabolism and redox status. That select metabolites were altered in liver of UCP3 Tg mice highlights that changes in muscle UCP3 activity can also affect other organ systems, presumably through changes in systemic metabolite trafficking.—Aguer, C., Piccolo, B. D., Fiehn, O., Adams, S. H., Harper, M.‐E. A novel amino acid and metabolomics signature in mice overexpressing muscle uncoupling protein 3. FASEB J. 31, 814–827 (2017). www.fasebj.org

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,023
Score d'incertitude au seuil0,284

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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