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Enregistrement W2552169191 · doi:10.1182/blood.v114.22.4198.4198

Molecular Basis for A Thrombophilic Patient's Combined Deficiencies in Proteins C and S.

2009· article· en· W2552169191 sur OpenAlexaff
Tyler Smith, I. S. Carter, Cedric John Carter, Ross T. A. MacGillivray

Notice bibliographique

RevueBlood · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBlood Coagulation and Thrombosis Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésExonProtein SMolecular biologyBiologyGeneGeneticsThrombophiliaProtein CBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Abstract 4198 Background/objectives Proteins C and S (PC and PS) are vitamin K-dependent plasma proteins with anticoagulant properties. Protein S functions as a non-enzymatic cofactor for activated protein C (APC). APC proteolytically degrades coagulation factors Va and VIIIa, thereby diminishing the activities of the prothrombinase and tenase complexes, respectively. The human PC gene (PROC) is located on the long arm of chromosome 2 (2q13-q14) and contains 9 exons which code for 461 amino acid residues. The human PS (PROS1) gene resides on chromosome 3 (3p11.1-q11.2) and contains 15 exons coding for 636 amino acid residues. Hereditary PS and PC deficiencies are both autosomal dominant disorders in which patients have diminished functional levels of the respective protein (usually ∼50% relative to normal controls). Clinically, this results in increased propensity toward thromboembolic disease, also known as thrombophilia. In this study, we describe a unique thrombophilic patient who has combined deficiencies in both proteins C and S. The objective of the study was to elucidate the precise genetic defect(s) causing these deficiencies. Methods Following purification of the patient's DNA from peripheral blood leukocytes, PCR amplifications were performed using oligonucleotide primers flanking all exons of the PROS1 and PROC genes. In addition, the 400bp region upstream of the first exon of PROS1 (corresponding to the promoter region) was also amplified by PCR. The PCR products were purified and their DNA sequences determined in both forward and reverse directions using the dye-terminator method. The resultant nucleotide sequences were compared with the PROS1 and PROC reference sequences [web address]. Results The patient was found to be heterozygous for a novel missense PROC gene mutation in exon 8, which codes in part for the proteolytic domain of protein C. The resulting ValàGly substitution of residue 221 is in close proximity to the catalytic triad, which could abrogate its enzymatic activity. Although no mutations were present in any of the patient's PROS1 exons, there was a novel heterozygous CàG nucleotide substitution in the PROS1 promoter region. This substitution is present within an Sp1 transcription factor binding site that is highly conserved among mammals. Therefore, this mutation could significantly diminish expression of the otherwise normal PROS1 gene, leading to the observed decreased protein S level. Both mutations are unreported in the literature and are not listed in the PROC and PROS1 mutation databases. Conclusions We have successfully identified two novel genetic defects leading to deficiencies of the anticoagulant proteins C and S in a patient with thrombophilia. Further studies are underway to confirm the suggested biochemical effects of the mutation on protein C and protein S gene expression. Disclosures: No relevant conflicts of interest to declare.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0030,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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