MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2552206015 · doi:10.1371/journal.pone.0166363

Expression of the lncRNA Maternally Expressed Gene 3 (MEG3) Contributes to the Control of Lung Cancer Cell Proliferation by the Rb Pathway

2016· article· en· W2552206015 sur OpenAlexaff
Traci Kruer, Susan Dougherty, Lindsey Reynolds, Elizabeth M. Long, Tanya de Silva, William W. Lockwood, Brian F. Clem

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related molecular mechanisms research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Cancer InstituteAmerican Cancer Society
Mots-clésMEG3Gene knockdownBiologyCell growthCancer researchDNA methylationMolecular biologyGene silencingCell cycleRetinoblastoma proteinGene expressionApoptosisLong non-coding RNADownregulation and upregulationGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Maternally expressed gene 3 (MEG3, mouse homolog Gtl2) encodes a long noncoding RNA (lncRNA) that is expressed in many normal tissues, but is suppressed in various cancer cell lines and tumors, suggesting it plays a functional role as a tumor suppressor. Hypermethylation has been shown to contribute to this loss of expression. We now demonstrate that MEG3 expression is regulated by the retinoblastoma protein (Rb) pathway and correlates with a change in cell proliferation. Microarray analysis of mouse embryonic fibroblasts (MEFs) isolated from mice with genetic deletion of all three Rb family members (TKO) revealed a significant silencing of Gtl2/MEG3 expression compared to WT MEFs, and re-expression of Gtl2/MEG3 caused decrease in cell proliferation and increased apoptosis. MEG3 levels also were suppressed in A549 lung cancer cells compared with normal human bronchial epithelial (NHBE) cells, and, similar to the TKO cells, re-constitution of MEG3 led to a decrease in cell proliferation and elevated apoptosis. Activation of pRb by treatment of A549 and SK-MES-1 cells with palbociclib, a CDK4/6 inhibitor, increased the expression of MEG3 in a dose-dependent manner, while knockdown of pRb/p107 attenuated this effect. In addition, expression of phosphorylation-deficient mutant of pRb increased MEG3 levels in both lung cancer cell types. Treatment of these cells with palbociclib also decreased the expression of pRb-regulated DNA methyltransferase 1 (DNMT1), while conversely, knockdown of DNMT1 resulted in increased expression of MEG3. As gene methylation has been suggested for MEG3 regulation, we found that palbociclib resulted in decreased methylation of the MEG3 locus similar to that observed with 5-aza-deoxycytidine. Anti-sense oligonucleotide silencing of drug-induced MEG3 expression in A549 and SK-MES-1 cells partially rescued the palbociclib-mediated decrease in cell proliferation, while analysis of the TCGA database revealed decreased MEG3 expression in human lung tumors harboring a disrupted RB pathway. Together, these data suggest that disruption of the pRb-DNMT1 pathway leads to a decrease in MEG3 expression, thereby contributing to the pro-proliferative state of certain cancer cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,040
Score d'incertitude au seuil0,232

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations77
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLoS ONEMême sujetCancer-related molecular mechanisms researchTravaux en français237 207