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Enregistrement W2552296496 · doi:10.1183/13993003.congress-2016.pa5068

Maintenance of IRF1 by MAPK inhibition: A mechanism by which DUSP1 reduces glucocorticoid inhibition of CXCL10

2016· article· en· W2552296496 sur OpenAlexaff
Suharsh Shah, Mahmoud Mostafa, Mohammed O. Altonsy, Robert Newton

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Tyrosine Phosphatases
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIRF1Gene silencingCell biologyGene expressionMolecular biologyBiologyA549 cellRegulation of gene expressionMAPK/ERK pathwayKinaseChemistryCancer researchGeneBiochemistryCell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: The mitogen-activated protein kinase (MAPK) phosphatase, DUSP1, mediates glucocorticoid repression of MAPKs and inflammatory gene expression. However, MAPK inhibition enhances expression of the transcription factor, IRF1. Hypothesis: Inhibition of MAPKs is a mechanism by which anti-inflammatory glucocorticoids maintain IRF1 and downstream gene expression. Methods: Pulmonary A549 and primary human bronchial epithelial (HBE) cells were treated with IL1B (1ng/ml) and dexamethasone (1μM). Gene expression was measured by qPCR, western blotting and ELISA. Results: In A549 cells, DUSP1 over-expression reduced IL1B-induced expression of many inflammatory genes, but enhanced expression of IRF1 and the IRF1-dependent gene, CXCL10. IL1B rapidly, but transiently, induced IRF1 mRNA and protein expression. MAPK inhibition had little effect on this induction, but markedly reduced the loss of IRF1 following peak expression. This involved a failure to reduce IRF1 transcription as well as stabilisation of IRF1 mRNA and protein. Silencing of IL1B-induced DUSP1 increased MAPK activation and reduced IRF1 expression. With IL1B+dexamethasone, DUSP1 silencing not only reduced IRF1 expression, but reduced CXCL10 expression. Thus limited repression by dexamethasone of IL1B-induced IRF1 and CXCL10 expression in A549 and on IRF1 in primary HBE cells is in part explained by: 1) induction of DUSP1, 2) inhibition of MAPKs, and 3) subsequently elevated IRF1 expression. Conclusions: These data confirm a regulatory network, whereby DUSP1 switches off MAPKs to maintain IRF1 expression. In the presence of dexamethasone, this maintains IRF1 and CXCL10 expression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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