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Enregistrement W2552450041 · doi:10.1182/blood.v118.21.3170.3170

Genetic Linkage of the Dehydrated Hereditary Stomatocytosis Locus to Chromosome 16 in Two Kindreds and Refinement of the Candidate Gene Region to 16q24.2 - 16qter,

2011· article· en· W2552450041 sur OpenAlexaffabout
Brett L. Houston, Teresa Zelinski, Donald S. Houston, Sara J. Israels, Gail Coghlan, Bernie N. Chodirker, Patrick G. Gallagher, Ryan Zarychanski

Notice bibliographique

RevueBlood · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueErythrocyte Function and Pathophysiology
Établissements canadiensCancerCare ManitobaUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLocus (genetics)GeneticsBiologyGenetic linkageAlleleGene mappingGenetic markerGenotypingGenotypeMolecular biologyGeneChromosome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Abstract 3170 BACKGROUND: The hereditary stomatocytoses are a rare, diverse group of clinical conditions associated with chronic red blood cell hemolysis and increased erythrocyte membrane permeability to monovalent cations. The most common form of hereditary stomatocytosis is dehydrated stomatocytosis (DHSt, also called hereditary xerocytosis) first reported by Miller et al. (Blood 38:184, 1971). We studied two genetically unrelated kindreds with DHSt, one from Western Canada and the other, the original DHSt kindred reported by Miller et al., from upstate New York. Although the DHSt causative gene is unknown, previous studies have mapped the DHSt locus to 16q23 – 16qter. OBJECTIVES: To define the chromosomal region carrying the disease locus in these two families using DNA linkage analysis. METHODS: PCR-based genotyping was performed on genomic DNA according to standard methods. Fine mapping was performed using markers on the telomeric end of chromosome 16. Linkage data was generated from both paternal and maternal meioses. LOD scores (logarithm (base 10) of odds) were determined at assumed recombination fractions (theta) 0.00, 0.05, 0.10, 0.20, 0.30 and 0.40. Continuous allelic alignments were manually generated. RESULTS: Based on reticulocyte count, MCHC, and osmotic fragility, disease phenotypes were identified in 29 individuals of the Canadian kindred, and 27 individuals of the New York kindred. Linkage data from both families confirmed that the disease-causing locus mapped to chromosome 16. In the Canadian kindred, significant LOD scores (> +3.00) were established between the disease-causing locus (DHSt) and D16S3074, D16S2621 and D16S3026. Three recombinants were observed between DHSt:D16S3074, two between DHSt:D16S2621 and none between DHSt:D16S3026. Significant LOD scores were also established between DHSt and D16S3074, D16S476, and D16S413 in the New York kindred, and recombination between DHSt:D16S3074 was also observed. Definition of critical recombination events allowed us to define the centromeric boundary of the region containing the disease-causing locus as D16S2621, a 2.4 cM region containing 51 known or predicted genes. CONCLUSIONS: Genetic linkage analysis has confirmed DHSt linkage to chromosome 16 in two unrelated kindreds and has refined the assignment of DHSt to chromosome 16q24.2 – 16qter. Disclosures: No relevant conflicts of interest to declare.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,342
Score d'incertitude au seuil0,318

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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