MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2552551718 · doi:10.1371/journal.pone.0166040

Somite-Derived Retinoic Acid Regulates Zebrafish Hematopoietic Stem Cell Formation

2016· article· en· W2552551718 sur OpenAlexafffund
Laura M. Pillay, Kacey Mackowetzky, Sonya A. Widen, Andrew J. Waskiewicz

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueZebrafish Biomedical Research Applications
Établissements canadiensWomen and Children’s Health Research InstituteUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAlberta InnovatesAlberta Innovates - Health Solutions
Mots-clésSomitogenesisCell biologyZebrafishBiologyNotch signaling pathwaySomiteDorsal aortaRetinoic acidStem cellHaematopoiesisHematopoietic stem cellHemangioblastLateral plate mesodermMesodermProgenitor cellParaxial mesodermSignal transductionGeneticsEmbryogenesisEmbryonic stem cellEmbryoGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hematopoietic stem cells (HSCs) are multipotent progenitors that generate all vertebrate adult blood lineages. Recent analyses have highlighted the importance of somite-derived signaling factors in regulating HSC specification and emergence from dorsal aorta hemogenic endothelium. However, these factors remain largely uncharacterized. We provide evidence that the vitamin A derivative retinoic acid (RA) functions as an essential regulator of zebrafish HSC formation. Temporal analyses indicate that RA is required for HSC gene expression prior to dorsal aorta formation, at a time when the predominant RA synthesis enzyme, aldh1a2, is strongly expressed within the paraxial mesoderm and somites. Previous research implicated the Cxcl12 chemokine and Notch signaling pathways in HSC formation. Consequently, to understand how RA regulates HSC gene expression, we surveyed the expression of components of these pathways in RA-depleted zebrafish embryos. During somitogenesis, RA-depleted embryos exhibit altered expression of jam1a and jam2a, which potentiate Notch signaling within nascent endothelial cells. RA-depleted embryos also exhibit a severe reduction in the expression of cxcr4a, the predominant Cxcl12b receptor. Furthermore, pharmacological inhibitors of RA synthesis and Cxcr4 signaling act in concert to reduce HSC formation. Our analyses demonstrate that somite-derived RA functions to regulate components of the Notch and Cxcl12 chemokine signaling pathways during HSC formation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,490

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLoS ONEMême sujetZebrafish Biomedical Research ApplicationsTravaux en français237 207