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Enregistrement W2552675751 · doi:10.1111/ivb.12152

Species delineation in the <i>Capitella</i> species complex (Annelida: Capitellidae): geographic and genetic variation in the northern Gulf of Mexico

2016· article· en· W2552675751 sur OpenAlexaboutno aff
Justin Hilliard, Marissa M. Hajduk, Anja Schulze

Notice bibliographique

RevueInvertebrate Biology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineEarth and Planetary Sciences
ThématiqueMarine Biology and Ecology Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Science Foundation
Mots-clésBiologyCapitataSpecies complexCladeEcologyCytochrome c oxidase subunit ISubspeciesZoologyPhylogeneticsPhylogenetic treeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Capitella capitata was traditionally used as a biological indicator species due to its ubiquitous distribution and high densities in disturbed and polluted marine and estuarine sediments. Based on allozyme and developmental studies, it is now clear that C. capitata is a species complex consisting of multiple distinct lineages worldwide, including the recently described C. teleta, a model species for spiralian development. The coast of the northern Gulf of Mexico, with its numerous bays and estuaries and frequently occurring natural and anthropogenic disturbances, provides an appropriate region for such studies. We sequenced a fragment of the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I gene for individuals of C. cf. capitata and C. cf. aciculata (distinguished by acicular spines on the first two chaetigers) collected from Texas and Florida coasts and analyzed them in conjunction with data available in GenBank. Our results indicate the presence of a Gulf of Mexico clade that is distinct from populations in Canada and the Indo‐Pacific. Populations in the northern Gulf of Mexico are structured geographically, with support for Texas and Florida clades, and there do not seem to be clear boundaries between C. cf. capitata and C. cf. aciculata. This is corroborated by the fact that multiple specimens were morphologically intermediate between the two species. In future studies, we aim to clarify whether the intermediate morphologies represent ontogenetic stages, neutral morphological variation, phenotypic plasticity, or sexual dimorphism in a single species or whether several lineages with incomplete reproductive barriers are present.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,033
Score d'incertitude au seuil0,065

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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