Prevalence of Alpha-Globin Gene Deletions amongst Patients with Unexplained Microcytosis in a North-American Population.
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Introduction: Increasing multi-ethnicity is likely to make α-thalassemia more prevalent in western metropolitan areas. The current prevalence of α-thalassemia in regions outside the traditional thalassemia areas with the associated risk for HbH disease and hydrops foetalis is unknown. Genetic counseling for reproductive risks due to α-globin gene mutations requires adequate and precise genotyping. Objectives: To determine by multiplex polymerase chain reaction (m-PCR) the prevalence and genotypes of α-thalassemia among non selected, consecutive cases of unexplained microcytosis identified in a clinical hematology laboratory. To evaluate if differences or variations in erythrocytic indices are indicative of α-thalassemia. Methods: During a period of 3 months, α-globin genotype was determined by m-PCR on all non repetitive microcytic (MCV <80fL) blood samples from adults with normal ferritin and normal hemoglobin HPLC analysis (Variant I, Bio-Rad). A previously described m-PCR analysis allowed the detection of α-globin gene deletions and specifically identified each of the following 7 deletions when present: −α3.7, −α4.2, −−SEA, −−FIL, −−MED, −−THAI and −α(20.5). Results: 516 microcytic blood samples were evaluated of which 197 had normal ferritin and Hb HPLC analysis and were submitted for m-PCR. Among 196 interpretable m-PCRs, 148 did not have α-globin gene deletion(s) (group 1) and 48 α-thalassemia cases (24,5%) were identified: 28 cases of single α-globin gene deletion (group 2) and 20 cases of 2 α-globin gene deletions (group 3). In group 3, 6 cases showed deletions in cis. Results on differences between the groups are presented in Table 1. Even though some differences were statistically different, none was clinically useful and diagnostic. Conclusion: A significant proportion (24,5%) of cases with microcytosis not likely explained by iron deficiency, inflammation or a hemoglobinopathy are caused by α-globin gene deletion(s). This laboratory survey, despite a short period of sample collection (3 months) identified 6 carriers of a 2 gene deletion in cis that may have a severe impact on reproductive decisions and potential future utilisation of resources. These findings are likely to be reproducible in other North American cosmopolitan cities where α-thalassemia is not endemic but likely to be of increasing prevalence due to immigration. The availability, precision and reliability of diagnostic methods such as m-PCR and the increasing ethnic diversity of North-American cities point to an emerging need to develop genetic counseling programs based on the molecular diagnosis of α-thalassemia. Erythrocytic parameters with their standard deviation in the different α-globin genotype groups RBC (x1012/L) MCH (pg) Hb (g/dL) Mentzer† RDW MCV (fL) † calculated for samples with Hb>90 g/L *indicates values that are significantly different from data of other groups. RBC: Red Blood Cells, MCH: Mean Corpuscular Hemoglobin, Hb: Hemoglobin, RDW: Red Cells Distribution Width, MCV: Mean Corpuscular Volume group 1 (normal genotype) 4,27±0,75 * 25±1,5 107±20 * 17,4±2,4 * 17,0±3,1 * 76,6±3,2 group 2 (single α-globin gene deletion) 4,70±0,85 25,2±1,5 118±22 16,2±2,9 * 15,1±2,1 76,9±3,5 group 3 (double α-globin gene deletion) 5,20±0,57 23,2±1,3 * 120±9 14,1±2,1 * 14,8±2,8 72,4±3,0 *
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».