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Enregistrement W2553079969 · doi:10.1186/s12936-016-1601-2

Parasitological correlates of Plasmodium ovale curtisi and Plasmodium ovale wallikeri infection

2016· article· en· W2553079969 sur OpenAlexaff
Melissa Phuong, Rachel Lau, Filip Ralevski, Andrea K. Boggild

Notice bibliographique

RevueMalaria Journal · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMalaria Research and Control
Établissements canadiensUniversity Health NetworkToronto Public HealthUniversity of TorontoPublic Health OntarioMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPlasmodium ovaleBiologyPlasmodium (life cycle)MalariaVirologyParasitologyParasite hostingPlasmodium falciparumPlasmodium vivaxGeneticsImmunologyZoology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Malaria, due to Plasmodium ovale, can be challenging to diagnose due to clinically mild disease and low parasite burden. Two genetically distinct sub-species of P. ovale exist: Plasmodium ovale curtisi (classic) and Plasmodium ovale wallikeri (variant). It is presently unknown if the sub-species causing infection affects performance of malaria diagnostic tests. The aim of this work was to understand how the genetically distinct sub-species, P. o. curtisi and P. o. wallikeri, affect malaria diagnostic tests. METHODS: Plasmodium ovale-positive whole blood specimens were sub-speciated by PCR and sequencing of 18S rRNA and dhfr-ts. Parasitaemia, morphology, pan-aldolase positivity, 18S copy number, and dhfr-ts sequences were compared between sub-species. RESULTS: From 2006 to 2015, 49 P. ovale isolates were identified, of which 22 were P. o. curtisi and 27 P. o. wallikeri; 80% were identified in the last five years, and 88% were acquired in West Africa. Sub-species did not differ by parasitaemia, 18S copy number, or pan-aldolase positivity. Lack of Schüffner's stippling was over-represented among P. o. wallikeri isolates (p = 0.02). Several nucleotide polymorphisms between the sub-species were observed, but they do not occur at sites believed to relate to antifolate binding. CONCLUSIONS: Plasmodium ovale is increasing among travellers to West Africa, although sub-species do not differ significantly by parasitologic features such as parasitaemia. Absence of Schüffner's stippling may be a feature specific to P. o. wallikeri and is a novel finding.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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