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Enregistrement W2553415893 · doi:10.1186/s12891-016-1318-y

The Scottish Early Rheumatoid Arthritis (SERA) Study: an inception cohort and biobank

2016· article· en· W2553415893 sur OpenAlexaff
James Dale, Caron Paterson, Ann Tierney, Stuart H. Ralston, David M. Reid, Neil Basu, John Harvie, Neil D McKay, Sarah Saunders, Hilary Wilson, Robin Munro, Ruth Richmond, Derek Baxter, Michael McMahon, John McLaren, Винод Кумар, Stefan Siebert, Iain B. McInnes, Duncan Porter

Notice bibliographique

RevueBMC Musculoskeletal Disorders · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRheumatoid Arthritis Research and Therapies
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesPfizer UKChief Scientist OfficePfizer
Mots-clésBiobankMedicineRheumatoid arthritisSports medicineRheumatologyCohortInternal medicineCohort studyEpidemiologyPhysical therapyOrthopedic surgeryIntensive care medicineSurgeryBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The Scottish Early Rheumatoid Arthritis (SERA) study is an inception cohort of rheumatoid (RA) and undifferentiated arthritis (UA) patients that aims to provide a contemporary description of phenotype and outcome and facilitate discovery of phenotypic and prognostic biomarkers METHODS: Demographic and clinical outcome data are collected from newly diagnosed RA/UA patients every 6 months from around Scotland. Health service utilization data is acquired from Information Services Division, NHS National Services Scotland. Plain radiographs of hands and feet are collected at baseline and 12 months. Additional samples of whole blood, plasma, serum and filtered urine are collected at baseline, 6 and 12 months RESULTS: Results are available for 1073 patients; at baseline, 76 % were classified as RA and 24 % as UA. Median time from onset to first review was 163 days (IQR97-323). Methotrexate was first-line DMARD for 75 % patients. Disease activity, functional ability and health-related quality of life improved significantly between baseline and 24 months, however the proportion in any employment fell (51 to 38 %, p = 0.0005). 24 % patients reported symptoms of anxiety and/or depression at baseline. 35/391 (9 %) patients exhibited rapid radiographic progression after 12 months. The SERA Biobank has accrued 60,612 samples CONCLUSIONS: In routine care, newly diagnosed RA/UA patients experience significant improvements in disease activity, functional ability and health-related quality of life but have high rates of psychiatric symptoms and declining employment rates. The co-existence of a multi-domain description of phenotype and a comprehensive biobank will facilitate multi-platform translational research to identify predictive markers of phenotype and prognosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,054
Score d'incertitude au seuil0,107

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,004
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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