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Enregistrement W2553434692 · doi:10.1371/journal.pone.0166733

The Devil Is in the Details: Incomplete Reporting in Preclinical Animal Research

2016· article· en· W2553434692 sur OpenAlexafffund
Marc T. Avey, David Moher, Katrina Sullivan, Dean Fergusson, Gilly Griffin, Jeremy Grimshaw, Brian Hutton, Manoj M. Lalu, Malcolm Macleod, John C. Marshall, Shirley H. J. Mei, Michael A. Rudnicki, Duncan J. Stewart, Alexis F. Turgeon, Lauralyn McIntyre

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineVeterinary
ThématiqueAnimal testing and alternatives
Établissements canadiensHôpital de l'Enfant-JésusUniversity of TorontoOttawa HospitalUniversité LavalUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Centre for the Replacement, Refinement and Reduction of Animals in Research
Mots-clésPreclinical researchOperationalizationMedicineReplicateClinical researchChecklistResearch designMEDLINEMedical physicsPsychologyPathologyStatisticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Incomplete reporting of study methods and results has become a focal point for failures in the reproducibility and translation of findings from preclinical research. Here we demonstrate that incomplete reporting of preclinical research is not limited to a few elements of research design, but rather is a broader problem that extends to the reporting of the methods and results. We evaluated 47 preclinical research studies from a systematic review of acute lung injury that use mesenchymal stem cells (MSCs) as a treatment. We operationalized the ARRIVE (Animal Research: Reporting of In Vivo Experiments) reporting guidelines for pre-clinical studies into 109 discrete reporting sub-items and extracted 5,123 data elements. Overall, studies reported less than half (47%) of all sub-items (median 51 items; range 37-64). Across all studies, the Methods Section reported less than half (45%) and the Results Section reported less than a third (29%). There was no association between journal impact factor and completeness of reporting, which suggests that incomplete reporting of preclinical research occurs across all journals regardless of their perceived prestige. Incomplete reporting of methods and results will impede attempts to replicate research findings and maximize the value of preclinical studies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,756
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,882
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Présentation des résultats · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,244
Score d'incertitude au seuil0,301

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,7560,882
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,003
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,005
Bibliométrie0,0180,019
Études des sciences et des technologies0,0040,018
Communication savante0,0130,015
Science ouverte0,0060,015
Intégrité de la recherche0,0060,008
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,808
Tête enseignante GPT0,539
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeObservationnel
DomainePrésentation des résultats
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations137
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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