Initial Results of an Ex Vivo Microfluidic Cis-Coculture Csra to Predict Response for Myeloma Patients
Notice bibliographique
Résumé
Abstract In vitro chemosensitivity and resistance assays (CSRAs) test primary tumor cells’ response to chemotherapeutic drugs. The goal of CSRAs is to potentially direct therapy based upon in vitro response. This is in contrast to empiric therapy of cancer patients where therapy is based on clinical trial evidence and the likelihood of patient response. However, most previous CSRAs have been unsuccessful; this may be because they employ tumor cells in mono-culture. increasing evidence indicates that heterogeneity in tumor cell biology and microenvironment and the interaction between the two play essential roles in regulating drug response. In addition, many of these assay and culture systems require more tumor cells per condition than can be obtained from every patient. Furthermore, coculture systems in the past often cultured tumor and non-tumor cells from different patients (trans-coculture). Therefore, a CSRA capable of being performed for all patients while incorporating both tumor cells and non-tumor microenvironmental cells from the same patient is needed. Here, by using a microfluidic ex vivo system requiring only thousands of cells per condition, we analyzed patient CD138+ multiple myeloma (MM) cells in either microfluidic mono-culture (MicroMC) or cis-coculture (MicroC3) with their own CD138- non-tumor mononuclear cells. The MM CD138+ cells were then exposed to varying doses of bortezomib, a clinical proteasome inhibitor, for 24 hours. An in-house software program, J’experiment, was used to calculate live fractions of the tumor cells. Because plasma concentrations of bortezomib peak at 100 nM, the change in live fraction was calculated from the 0 and 100 nM dose of bortezomib. Using k-means and Gaussian mixture clustering techniques, MicroC3 responses could be grouped into two distinct data clusters which correctly identified 17/17 patients as either clinically responsive (7) or non-responsive (10). On the other hand, responses measured in MicroMC could not be unambiguously separated into clinical response groups. Thus, MicroC3 accurately identified MM patient responses as either responsive or non-responsive to bortezomib-containing therapy. Further development of MicroC3 as a CSRA with the ability to rapidly identify chemosensitive or resistant cancer patients will enable more personalized therapeutic decisions. Disclosures Beebe: Bellbrook Labs, LLC: Equity Ownership, Membership on an entity's Board of Directors or advisory committees, Patents & Royalties.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».