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Enregistrement W2553763035 · doi:10.2527/jam2016-0219

0219 Modulation of the gut microbiota: An ecological perspective

2016· article· en· W2553763035 sur OpenAlexaff
Jens Walter

Notice bibliographique

RevueJournal of Animal Science · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMicrobiomeBiologyGut microbiomeGut floraEcologyHuman Microbiome ProjectProbioticHuman microbiomeHuman healthDietary fiberComputational biologyBioinformaticsImmunologyGeneticsMedicineBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Diverse strategies have been used for several decades to improve human and animal health through the modulation of the gut microbiota, spanning from the administration of defined probiotic strains (or Live Biotherapeutics), whole microbial consortia (e.g., fecal bacteriotherapy), to the provision of bacterial growth substrates (prebiotics and dietary fiber). However, we still lack a conceptual understanding on how the gut microbiota can be modulated. In this presentation I will summarize how ecological theory can provide a framework by which to understand characteristics of the human gut microbiota and the impact of microbiome-modulating strategies. I will present some of our own studies that investigated basic ecological questions regarding how the temporal, spatial, and global patterns of the human microbiome, the factors that shape these patterns, and the ecological constraints within the human microbiome can be manipulated by diet and probiotics. The methodological toolset that is now available (e.g., through next-generation sequencing) provides an unprecedented opportunity to obtain phylogenetic, compositional, and functional information of microbial communities. When analyzed in the light of ecological theory, this has the potential to elucidate the factors and ecological processes that determine and potentially predict the response of the gut microbiota to therapeutic modulations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,300
Écart entre enseignants0,286 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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