MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2554166769 · doi:10.1093/infdis/jiw343

A Platform for Monitoring Regional Antimicrobial Resistance, Using Online Data Sources: ResistanceOpen

2016· article· en· W2554166769 sur OpenAlexaffabout
Derek R. MacFadden, David N. Fisman, Jeff Andre, Yuki Ara, Maimuna S. Majumder, Isaac I. Bogoch, Nick Daneman, Annie Wang, Marianna Vavitsas, Lucas Castellani, John S. Brownstein

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Infectious Diseases · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAntibiotic Use and Resistance
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAntimicrobialAntibiotic resistanceComputer scienceMicrobiologyComputational biologyBiologyAntibiotics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: Our understanding of the global burden of antimicrobial resistance is limited. Complementary approaches to antimicrobial resistance surveillance are needed. Methods: We developed a Web-based/mobile platform for aggregating, analyzing, and disseminating regional antimicrobial resistance information. Antimicrobial resistance indices from existing but disparate online sources were identified and abstracted. To validate antimicrobial resistance data, in the absence of regional comparators, US and Canadian indices were aggregated and compared to existing national and state estimates. Measures of variability of antimicrobial susceptibility were determined for the United States and Canada to evaluate magnitudes of differences within countries. Results: Over 850 resistance indices globally were identified and abstracted, totaling >5 million isolates, from 340 unique locations. Resistance index coverage spanned 41 countries, 6 continents, 43 of 50 US states, and 8 of 10 Canadian provinces. When compared to reported values, aggregated resistance values for the United States and Canada during 2013 and 2014 demonstrated agreements ranging from 94% to 97%. For the United States, state-specific resistance estimates demonstrated an agreement of 92%. Large differences in antimicrobial susceptibility were seen within countries. Conclusions: Using existing nontraditional data sources, we have developed a Web-based platform for aggregating antimicrobial resistance indices to support monitoring of regional antimicrobial resistance patterns.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,575
Score d'incertitude au seuil0,334

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,295
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations32
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe Journal of Infectious DiseasesMême sujetAntibiotic Use and ResistanceTravaux en français237 207