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Enregistrement W2554505213 · doi:10.1186/s13643-016-0373-7

Evaluating Data Abstraction Assistant, a novel software application for data abstraction during systematic reviews: protocol for a randomized controlled trial

2016· article· en· W2554505213 sur OpenAlexaff
Ian J. Saldanha, Christopher H. Schmid, Joseph Lau, Kay Dickersin, Jesse A. Berlin, Jens Jap, Bryant T Smith, Simona Carini, Wiley Chan, Berry de Bruijn, Byron Wallace, Susan Hutfless, Ida Sim, M. Hassan Murad, Sandra A. Walsh, Elizabeth J. Whamond, Tianjing Li

Notice bibliographique

RevueSystematic Reviews · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineDecision Sciences
ThématiqueMeta-analysis and systematic reviews
Établissements canadiensCochraneNational Research Council Canada
Organismes subventionnairesBrown UniversityJohns Hopkins Bloomberg School of Public HealthPatient-Centered Outcomes Research InstituteJohns Hopkins UniversityWorld Health Organization
Mots-clésAbstractionComputer scienceAbstraction model checkingProtocol (science)Randomized controlled trialSystematic reviewData miningMedicineTheoretical computer scienceModel checkingMEDLINE

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Data abstraction, a critical systematic review step, is time-consuming and prone to errors. Current standards for approaches to data abstraction rest on a weak evidence base. We developed the Data Abstraction Assistant (DAA), a novel software application designed to facilitate the abstraction process by allowing users to (1) view study article PDFs juxtaposed to electronic data abstraction forms linked to a data abstraction system, (2) highlight (or "pin") the location of the text in the PDF, and (3) copy relevant text from the PDF into the form. We describe the design of a randomized controlled trial (RCT) that compares the relative effectiveness of (A) DAA-facilitated single abstraction plus verification by a second person, (B) traditional (non-DAA-facilitated) single abstraction plus verification by a second person, and (C) traditional independent dual abstraction plus adjudication to ascertain the accuracy and efficiency of abstraction. METHODS: This is an online, randomized, three-arm, crossover trial. We will enroll 24 pairs of abstractors (i.e., sample size is 48 participants), each pair comprising one less and one more experienced abstractor. Pairs will be randomized to abstract data from six articles, two under each of the three approaches. Abstractors will complete pre-tested data abstraction forms using the Systematic Review Data Repository (SRDR), an online data abstraction system. The primary outcomes are (1) proportion of data items abstracted that constitute an error (compared with an answer key) and (2) total time taken to complete abstraction (by two abstractors in the pair, including verification and/or adjudication). DISCUSSION: The DAA trial uses a practical design to test a novel software application as a tool to help improve the accuracy and efficiency of the data abstraction process during systematic reviews. Findings from the DAA trial will provide much-needed evidence to strengthen current recommendations for data abstraction approaches. TRIAL REGISTRATION: The trial is registered at National Information Center on Health Services Research and Health Care Technology (NICHSR) under Registration # HSRP20152269: https://wwwcf.nlm.nih.gov/hsr_project/view_hsrproj_record.cfm?NLMUNIQUE_ID=20152269&SEARCH_FOR=Tianjing%20Li . All items from the World Health Organization Trial Registration Data Set are covered at various locations in this protocol. Protocol version and date: This is version 2.0 of the protocol, dated September 6, 2016. As needed, we will communicate any protocol amendments to the Institutional Review Boards (IRBs) of Johns Hopkins Bloomberg School of Public Health (JHBSPH) and Brown University. We also will make appropriate as-needed modifications to the NICHSR website in a timely fashion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,682
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,751
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Méta-épidémiologie (sens strict), Méta-épidémiologie (sens large), Communication savante, Science ouverte, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesMétarecherche, Méta-épidémiologie (sens strict)
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: Protocole
Score de désaccord entre enseignants0,772
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,6820,751
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0400,007
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0070,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,865
Tête enseignante GPT0,626
Écart entre enseignants0,239 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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