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Enregistrement W2554710609 · doi:10.2527/jam2016-1627

1627 Molecular physiology of rumen papillae following an acidosis challenge

2016· article· en· W2554710609 sur OpenAlexaff
Coral Kent-Dennis, J. Alex Pasternak, G.B. Penner

Notice bibliographique

RevueJournal of Animal Science · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineVeterinary
ThématiqueAnimal health and immunology
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRumenAcidosisPhysiologyBiologyFood scienceEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The objective of this experiment was to evaluate the effect of ruminal acidosis on transcript abundance and localization of proteins regulated by local inflammation in the ruminal epithelium. Seven ruminally cannulated beef cows were used in a crossover design with two periods and two treatments (acidosis or control). Heifers were fed a baseline TMR with 50:50 forage to concentrate ratio and DMI was recorded daily. The acidosis induction consisted of feed restriction (25% of DMI for 1 d) followed by a grain challenge (30% of baseline DMI) and provision of the full TMR. Ruminal pH was monitored using indwelling probes and ruminal papillae biopsies were collected on d 2 and 6 following the induction of acidosis for RNA extraction and immuno-histofluorescence. Prostaglandin-endoperoxide synthase (PTGS1) and PTGS2 facilitate prostaglandin synthesis and were selected as targets because expression is thought to be regulated by inflammation. Gene expression was measured by quantitative real-time PCR, normalized to the geometric mean of three housekeeping genes within period. Immuno-histofluorescence of toll-like receptor (TLR)-9 and TLR-4 were used to evaluate localization in a subset of samples. Statistical analysis was performed using the MIXED procedure of SAS 9.4, with treatment and period as fixed effects. A pH threshold of 5.8 was used to define the occurrence of ruminal acidosis. During the day of the grain challenge, ruminal pH for acidosis cows was below pH 5.8 for 543 min, whereas pH of controls did not fall below the threshold at any time (P = 0.02). Minimum and mean pH were less on the challenge day (min: 5.4 vs. 6.2 ± 0.17 and mean: 5.9 vs. 6.6 ± 0.14, respectively; P < 0.01) for acidosis than control cows. Two days after acidosis induction, transcriptional abundance of PTGS1 and PTGS2 in ruminal papillae were decreased by 1.37 (P = 0.02) and 2.08 (P < 0.01) fold, respectively, relative to controls. When evaluated at d 6, no differences were observed. TLR-9 was not ubiquitously expressed, but rather was concentrated in small areas within regions of the ruminal epithelium. TLR4 was intracellularly expressed in the stratum basale, stratum spinosum, and stratum granulosum regardless of treatment. The results of this study suggest a potential acute anti-inflammatory response following acidosis, which was also tightly regulated. However, the downregulation of PTGS2 was unexpected; related transcripts are being studied to elucidate these effects.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,056
Tête enseignante GPT0,366
Écart entre enseignants0,310 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
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