MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2554855566 · doi:10.2527/jam2016-0474

0474 Comparison of digestion and particle-associated bacteria after in situ incubation of different barley varieties in the rumen of cattle

2016· article· en· W2554855566 sur OpenAlexaff
Hee Eun Yang, C. A. Zotti, J. J. McKinnon, Tim A. McAllister

Notice bibliographique

RevueJournal of Animal Science · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueAgriculture and Rural Development Research
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRumenStarchDigestion (alchemy)BiologyIncubationDry matterFirmicutesFood scienceSilageBacteriaAnimal scienceAgronomyChemistry16S ribosomal RNABiochemistryFermentationChromatography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The chemical composition of barley grain, including the structure of starch, can vary among barley varieties and result in different digestion efficiencies. It is not known if compositional differences in barley can affect the particle-associated bacteria (PAB) involved in digestion. Therefore, the objective of this study was to characterize the in situ rumen digestion and PAB of four barley grain varieties. Three ruminally-cannulated cattle were fed a diet of 60% barley silage, 37% barley grain and 3% supplement. Four different barley varieties (Fibar, Xena, McGwire and Hilose) and corn as a control were included in the experiment. Ground grains (3 g) were placed in nylon bags and incubated in the rumen of cattle for 0, 2, 4, 12, 24, and 48 h. At each time point, triplicate bags were removed from each animal and analyzed for dry matter (DM), starch and crude protein (CP) disappearance. A second set of bags (n = 3) containing 5 g of each grain were incubated for 2, 4, and 12 h and DNA was extracted to characterize PAB via 16S rRNA gene sequencing. McGwire had the highest effective degradability (ED) of DM (P < 0.01), followed by Xena, Fibar, Hilose, and corn, respectively. The ED of starch was highest (P < 0.01) for Xena, followed by McGwire, Fibar, Hilose, and corn, while CP disappearance was not affected by grain type. Overall, 15 phyla were identified after analysis of 16S rRNA genes. Barley variety did not affect the relative abundance of phyla however they did differ with incubation time. Firmicutes (19.2%), Bacteroidetes (18.27%) and Proteobacteria (8.89%) were the dominant phyla after 2 h of incubation. By 12 h, Bacteroidetes decreased to a relative abundance of 4.3%. In contrast, Firmicutes increased in abundance over time, accounting for 45.9 and 82.1% of PAB after 4 and 12 h of incubation, respectively. Principal Coordinate Analysis showed that bacterial populations clearly grouped according to incubation time. At the family level, Lactobacillaceae increased over time, with a relative abundance of 0.76, 6.49, and 76.3% at 2, 4, and 12 h, respectively, reflecting an increasing presence of lactic-acid producing bacteria. This study found that the diversity of PAB on barley grain was not affected by barley variety, despite there being differences in digestion kinetics. However, time affected PAB, illustrating that the bacterial biofilm involved in the digestion of grains clearly undergoes compositional shifts during ruminal digestion.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Animal ScienceMême sujetAgriculture and Rural Development ResearchTravaux en français237 207