0466 The effect of SNPs in the promoter on expression of CYP2E1 gene and boar taint
Notice bibliographique
Résumé
Boar taint, an unfavorable odor detected in the meat of intact male pigs, is caused by the accumulation of two compounds: androstenone and skatole. Despite mounting welfare concerns, surgical castration of all male piglets is still the most common control method in production systems. The need for new methods to control boar taint is therefore a necessity. Genetic selection represents one such alternative. Among the genes known to be involved in boar taint metabolism, CYP2E1 has repeatedly proven influential. The aim of this study was to identify SNPs within the CYP2E1 promoter affecting gene expression and boar taint. Genotypes were obtained from a previously developed list of 7 single nucleotide polymorphisms (SNPs) on 66 boars from three major swine breeds: Duroc, Landrace and Yorkshire. RNA was isolated from liver tissue and quantitative PCR was performed to measure CYP2E1 gene expression. Association analysis was run correlating genotype and CYP2E1 expression (ΔCT) using PROC GLM (SAS Version 9.4). Weight was included as a fixed effect. The effect of breed, androstenone and skatole concentrations on CYP2E1 expression were also tested. All SNPs had a MAF > 0.05. Results indicated that 1 SNP within the CYP2E1 promoter was significantly associated with CYP2E1 expression at α < 0.05. An additional 3 SNPs demonstrated association at α < 0.10. While weight was significantly associated with gene expression, breed was found to have no effect. Significant within breed variation in CYP2E1 expression was observed, indicating significant differences in gene expression among individuals. Androstenone and skatole were significantly associated, with means of 1.33 ug/g and 0.58 ug/g, respectively. Though SNPs were significantly associated with gene expression, no associations were observed between gene expression and androstenone or skatole in fat. Due to this lack of association between expression and boar taint, results indicate that CYP2E1 mRNA expression alone is not a key indicator for boar taint.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».