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Enregistrement W2555459351 · doi:10.12688/f1000research.8680.1

Three general concepts to improve risk prediction: good data, wisdom of the crowd, recalibration

2016· preprint· en· W2555459351 sur OpenAlexaff
Ivan Kondofersky, Michael Laimighofer, Christoph Kurz, Norbert Krautenbacher, Julia F. Söllner, Philip Dargatz, Hagen Scherb, Donna P. Ankerst, Christiane Fuchs

Notice bibliographique

RevueF1000Research · 2016
Typepreprint
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueStatistical Methods in Clinical Trials
Établissements canadiensInstitute of Health Economics
Organismes subventionnairesDeutsche ForschungsgemeinschaftEuropean Commission
Mots-clésInterimProstate cancerAutomatic summarizationClinical trialComputer scienceData collectionMedicineData scienceMedical physicsArtificial intelligenceCancerStatisticsInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

<ns4:p>In today's information age, the necessary means exist for clinical risk prediction to capitalize on a multitude of data sources, increasing the potential for greater accuracy and improved patient care. Towards this objective, the Prostate Cancer DREAM Challenge posted comprehensive information from three clinical trials recording survival for patients with metastatic castration-resistant prostate cancer treated with first-line docetaxel. A subset of an independent clinical trial was used for interim evaluation of model submissions, providing critical feedback to participating teams for tailoring their models to the desired target. Final submitted models were evaluated and ranked on the independent clinical trial. Our team, called "A Bavarian Dream", utilized many of the common statistical methods for data dimension reduction and summarization during the trial. Three general modeling principles emerged that were deemed helpful for building accurate risk prediction tools and ending up among the winning teams of both sub-challenges. These principles included: first, good data, encompassing the collection of important variables and imputation of missing data; second, wisdom of the crowd, extending beyond the usual model ensemble notion to the inclusion of experts on specific risk ranges; and third, recalibration, entailing transfer learning to the target source. In this study, we illustrate the application and impact of these principles applied to data from the Prostate Cancer DREAM Challenge.</ns4:p>

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,012
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,168
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Science ouverte, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,682
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0120,168
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0040,009
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,625
Tête enseignante GPT0,606
Écart entre enseignants0,019 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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