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Enregistrement W2556111075 · doi:10.1371/journal.pone.0165138

MicroRNA Expression Patterns of CD8+ T Cells in Acute and Chronic Brucellosis

2016· article· en· W2556111075 sur OpenAlexaff
Ferah Budak, Salih Haldun Bal, Gülçin Tezcan, Furkan Guvenc, Halis Akalın, Güher Göral, Günnur Deniz, Haluk Barbaros Oral

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineVeterinary
ThématiqueBrucella: diagnosis, epidemiology, treatment
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesBursa Uludağ Üniversitesi
Mots-clésBiologyCD8ImmunologymicroRNAImmune systemKEGGFlow cytometryGene expressionGeneTranscriptomeGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Although our knowledge about Brucella virulence factors and the host response increase rapidly, the mechanisms of immune evasion by the pathogen and causes of chronic disease are still unknown. Here, we aimed to investigate the immunological factors which belong to CD8+ T cells and their roles in the transition of brucellosis from acute to chronic infection. Using miRNA microarray, more than 2000 miRNAs were screened in CD8+ T cells of patients with acute or chronic brucellosis and healthy controls that were sorted from peripheral blood with flow cytometry and validated through qRT-PCR. Findings were evaluated using GeneSpring GX (Agilent) 13.0 software and KEGG pathway analysis. Expression of two miRNAs were determined to display a significant fold change in chronic group when compared with acute or control groups. Both miRNAs (miR-126-5p and miR-4753-3p) were decreased (p <0.05 or fold change > 2). These miRNAs have the potential to be the regulators of CD8+ T cell-related marker genes for chronic brucellosis infections. The differentially expressed miRNAs and their predicted target genes are involved in MAPK signaling pathway, cytokine-cytokine receptor interactions, endocytosis, regulation of actin cytoskeleton, and focal adhesion indicating their potential roles in chronic brucellosis and its progression. It is the first study of miRNA expression analysis of human CD8+ T cells to clarify the mechanism of inveteracy in brucellosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,095
Score d'incertitude au seuil0,644

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,078
Tête enseignante GPT0,296
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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