MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W2556796635 · doi:10.1182/blood.v116.21.2903.2903

ARNT/HIF-1β: An AML Biomarker?

2010· article· en· W2556796635 sur OpenAlexaff
Selena Joy Williams, Chunhong Gu, Joelle dela Paz, Rena Buckstein, Richard A. Wells

Notice bibliographique

RevueBlood · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Hypoxia, and Metabolism
Établissements canadiensHealth Sciences CentreSunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAryl hydrocarbon receptor nuclear translocatorCancer researchBone marrowHaematopoiesisChromosomal translocationBiologyFusion geneMyeloidTranscription factorStem cellMedicineImmunologyGeneAryl hydrocarbon receptorGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Abstract 2903 Background: Despite improvements in chemotherapy protocols and bone marrow transplantation techniques, AML remains a lethal disease. Although patients with AML typically respond well to initial therapy, the majority relapse and eventually succumb to the disease. This relapse is thought to be the result of the resistance of leukaemic stem cells to the effects of chemotherapy. Some mechanisms have been discovered which contribute to resistance, but this phenomenon remains incompletely understood and is a significant barrier to improving patient outcomes. TEL is a member of the ETS transcription factor gene family and is essential for developmental processes such as haematopoiesis. TEL is frequently targeted by chromosomal translocations in human malignancies, resulting in the expression of oncogenic TEL gene fusions. A TEL-ARNT gene fusion was reported in a single case of AML, FAB subtype M2, in a patient whose leukaemic cells contained the balanced translocation t(1;12)(q21;p13). ARNT (also known as HIF-1β) is a nuclear protein and functions as part of a heterodimer, whose partners include HIF-1α and the aryl hydrocarbon receptor (AhR). HIF-1 expression is commonly deregulated in cancer and AhR signalling has been linked to leukaemogenesis. Materials and Results: Immunoblot analysis of patient bone marrow mononuclear cell lysates revealed that 5 of 29 AML specimens (∼17%) had elevated levels of ARNT protein, whereas 0 of 19 MDS specimens showed ARNT expression. In addition, AML specimens that had elevated ARNT protein levels also had elevated levels of phosphorylated Akt, while AML specimens that did not have elevated ARNT protein expression did not have activation of Akt signaling. Intriguingly, ARNT expression was noted in one patient who had progressed from MDS to AML. We then studied the expression of ARNT in HL60 cells, which are highly sensitive to induction of apoptosis by troglitazone (TG), and in U937 cells, which are TG resistant. In HL60 cells, ARNT mRNA levels remained constant following TG treatment and ARNT protein levels markedly decreased, while in U937 cells, ARNT mRNA levels increased and ARNT protein levels remained constant. We then tested the effect of exogenous expression of ARNT on the sensitivity of HL-60 cells to apoptosis induced by TG, daunorubin and hydrogen peroxide. HL-60 cells transduced with a retrovirus expressing ARNT became resistant to the induction of apoptosis by all these agents. These cells also had constitutive activation of Akt signaling, and treatment of these cells with a specific inhibitor of Akt signaling reversed their resistance to TG-induced apoptosis. Conclusions: The expression of ARNT confers resistance to apoptosis in AML cell lines and activates Akt signalling. In addition, ARNT is overexpressed in a significant subset of AML patients, in whom it activated Akt signaling, and ARNT expression correlates with progression of MDS to AML. ARNT may play an important role in chemoresistance and may be useful as a predictive or prognostic biomarker. Disclosures: No relevant conflicts of interest to declare.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBlood→Même sujetCancer, Hypoxia, and Metabolism→Travaux en français237 207→