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The International Human Epigenome Consortium: A Blueprint for Scientific Collaboration and Discovery
H.G. Stunnenberg, Sergio Abrignani, David J. Adams, Melanie de Almeida, Lucia Altucci, Viren Amin, Ido Amit, Stylianos E. Antonarakis, Samuel Aparício, Takahiro Arima, Laura Arrigoni, Rob J.W. Arts, Vahid Asnafi, Manel Esteller, Jae‐Bum Bae, Kevin Baßler, Stephan Beck, Benjamin E. Berkman, B Bernstein, Mikhail Bilenky, Adrian Bird, Christoph Bock, Bernhard O. Boehm, Guillaume Bourque, Charles E. Breeze, Benedikt Brors, David Bujold, Oliver S. Burren, Marion J.G. Bussemakers, Adam S. Butterworth, Elı́as Campo, Enrique Carrillo de Santa Pau, Lisa H. Chadwick, Kui Ming Chan, Wei Chen, Tom H. Cheung, Luca Chiapperino, Ho‐Ryun Chung, Laura Clarke, Joseph M. Connors, Philippe Cronet, John Danesh, Manolis Dermitzakis, Gerard Drewes, Pawel Durek, Stephanie O. M. Dyke, Tomasz Dyląg, Connie J. Eaves, Peter Ebert, Roland Eils, Catherine Ennis, Tariq Enver, Elise A. Feingold, Bärbel Felder, Anne C. Ferguson‐Smith, Jude Fitzgibbon, Paul Flicek, Roger Foo, Peter Fraser, Mattia Frontini, Eileen E. M. Furlong, Sitanshu Gakkhar, Nina Gasparoni, Gilles Gasparoni, Daniel H. Geschwind, Petar Glažar, Thomas Graf, Frank Grosveld, Xin‐Yuan Guan, Roderic Guigó, Marta Gut, Alf Hamann, Bok-Ghee Han, R. Alan Harris, Simon Heath, Kristian Helin, Jan G. Hengstler, Alireza Heravi‐Moussavi, Karl Herrup, Steven Hill, Jason A. Hilton, Benjamin C. Hitz, Bernhard Horsthemke, Ming Hu, Jooyeon Hwang, Nancy Y. Ip, Takashi Ito, Biola M. Javierre, Sasa Jenko, Thomas Jenuwein, Yann Joly, Steven J.M. Jones, Yae Kanai, Hee Gyung Kang, Aly Karsan, Alexandra K. Kiemer, Song Cheol Kim, Bong-Jo Kim, Hiroshi Kimurâ, Sarah Kinkley, Filippos Klironomos, In-Uk Koh, Myrto Kostadima, Christopher Kressler, Roman Kreuzhuber, Anshul Kundaje, Ralf Küppers, Carolyn A. Larabell, Paul Lasko, Mark Lathrop, Daniel H. S. Lee, Suman Lee, Hans Lehrach, Elsa Leitão, Thomas Lengauer, Åke Lernmark, Richard David Leslie, Gkk Leung, Danny Leung, Markus Loeffler, Yussanne Ma, Antonello Mai, Thomas Manke, Éric Marcotte, Marco A. Marra, Joost H.A. Martens, José I. Martín‐Subero, Karen J. Maschke, Christoph A. Merten, Aleksandar Milosavljević, Saverio Minucci, Totai Mitsuyama, Richard A. Moore, Fabian Müller, Andrew J. Mungall, M. G. Netea, Karl Nordström, Iréne Norstedt, Hiroaki Okae, Vitor Onuchic, B. F. Francis Ouellette, Willem H. Ouwehand, Massimiliano Pagani, Véra Pancaldi, Thomas Pap, Tomi Pastinen, Ronak Patel, Dirk S. Paul, Michael J. Pazin, Pier Giuseppe Pelicci, Anthony G. Phillips, Julia K. Polansky, Bo Porse, J. Andrew Pospisilik, Shyam Prabhakar, Dena C. Procaccini, Andreas Radbruch, Nikolaus Rajewsky, Vardham Rakyan, Wolf Reik, Bing Ren, David Richardson, Andreas S. Richter, Daniel Rico, David J. Roberts, Philip Rosenstiel, Mark A. Rothstein, Abdulrahman Salhab, Hiroyuki Sasaki, John S. Satterlee, Sascha Sauer, C. Schacht, Florian Schmidt, Gerd Schmitz, Stefan Schreiber, Christopher Schröder, Dirk Schübeler, Joachim L. Schultze, Ronald P. Schulyer, Marcel H. Schulz, Martin Seifert, Katsuhiko Shirahige, Reiner Siebert, Thomas Sierocinski, Laura A. Siminoff, Anupam Sinha, Nicole Soranzo, Salvatore Spicuglia, Mikhail Spivakov, Christian Steidl, J. Seth Strattan, Michael Stratton, Peter Südbeck, Hao Sun, Narumi Suzuki, Yutaka Suzuki, Amos Tanay, David Torrents, Frederick L. Tyson, Thomas Ulas, Sebastian Ullrich, Toshikazu Ushijima, Alfonso Valencia, Edo Vellenga, Martin Vingron, Chris Wallace, Stefan Wallner, Jörn Walter, Huating Wang, Stephanie Weber, Andreas Weller, Andrew P. Weng, Steven P. Wilder, Sam M. Wiseman, Angela Ruohao Wu, Zhenguo Wu, Jieyi Xiong, Yasuhiro Yamashita, Xinyi Yang, Desmond Y. H. Yap, Kevin Y. Yip, Stephen Yip, Jaeil Yoo, Daniel R. Zerbino, Gideon Zipprich, Martin Hirst
Notice bibliographique
RevueCell · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British ColumbiaBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilMedical Research CouncilNational Institute for Health and Care ResearchBritish Heart FoundationCancer Research UK
Mots-clésBiologyEpigenomeBlueprintScientific discoveryComputational biologyData scienceGeneticsDNA methylationGeneComputer scienceCognitive scienceEngineering
Résumé
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.
Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
score de la tête « metaresearch » (Codex)0,103
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,067
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,103
Score d'incertitude au seuil0,546
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,103 | 0,067 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,003 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,005 | 0,006 |
| Études des sciences et des technologies | 0,005 | 0,006 |
| Communication savante | 0,011 | 0,010 |
| Science ouverte | 0,005 | 0,029 |
| Intégrité de la recherche | 0,011 | 0,013 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,014 | 0,004 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,251 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».
En bref
Citations563
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentnon