Novel E2 Glycoprotein Tetramer Detects Hepatitis C Virus–Specific Memory B Cells
Notice bibliographique
Résumé
Acute hepatitis C virus (HCV) infection culminates in viral persistence in the majority of cases. Abs that recognize the envelope glycoproteins E1 and E2 are generated during the late stages of acute infection, yet their contribution to spontaneous viral clearance remains controversial. Investigation of the humoral responses during acute HCV infection have been limited by the inability to directly identify and characterize HCV-specific B cells. In this study we describe the development of a novel tetramer of the E2 glycoprotein ectodomain (J6, genotype 2a strain), which allowed us to visualize E2-specific B cells longitudinally in the peripheral blood of HCV-infected individuals. HCV-specific class-switched memory B cells were detected in 3 out of 7 participants during late acute infection, with a mean frequency of 0.63% for positive samples (range 0.16-0.67%) and in 7 out of 7 participants with chronic infection with a mean frequency of 0.47% (range 0.20-0.78%). In a cross-sectional study, E2 tetramer positive population was detected in 28 out of 31 chronically infected individuals. Deep sequencing of the BCR from E2-specific class-switched memory B cells sorted from two independent participants revealed a focused repertoire suggestive of clonal selection. Tetramer-specific B cells exhibited skewed CDR3 length distribution and increased mutation frequency compared with naive B cells. This BCR profile is indicative of clonal expansion and affinity maturation. E2 tetramer allows for specific and sensitive ex vivo characterization of rare HCV-specific B cells in infected individuals, and will enable researchers to gain a better understanding of humoral immunity in HCV infection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».