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Enregistrement W2557058069 · doi:10.1007/s10535-016-0678-3

Detection of DNA methylation pattern in thidiazuron-induced blueberry callus using methylation-sensitive amplification polymorphism

2016· article· en· W2557058069 sur OpenAlex
Amrita Ghosh, Abir U. Igamberdiev, Samir C. Debnath

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueBiologia Plantarum · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensMemorial University of NewfoundlandAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCallusMethylationDNA methylationBiologyGenotypeCytosineTissue cultureMolecular biologyGeneGene expressionBotanyGeneticsIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

During the normal developmental process, programmed gene expression is an essential phenomenon in all organisms. In eukaryotes, DNA methylation plays an important role in the regulation of gene expression. The extent of cytosine methylation polymorphism was evaluated in leaf tissues collected from the greenhouse grown plants and in in vitro-derived callus of three lowbush and one hybrid blueberry genotypes, using methylation-sensitive amplification polymorphism (MSAP) technique. Callus formation started from the leaf segments after 4 weeks of culture on a thidiazuron (TDZ) containing medium. Maximum callus formation (98 %) was observed in the hybrid blueberry at 1.0 mg dm-3 TDZ. Although noticeable changes in cytosine methylation pattern were detected within the MSAP profiles of both leaf and callus tissues, methylation events were more polymorphic in calli than in leaf tissues. The number of methylated CCGG sites varied significantly within the genotypes ranging from 75 to 100 in leaf tissues and from 215 to 258 in callus tissues. Differences in the methylation pattern were observed not only in a tissue-specific manner but also within the genotype in a treatment specific manner. These results demonstrated the unique effect of TDZ and the tissue culture process on DNA methylation during callus development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,370
Score d'incertitude au seuil0,330

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle