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Enregistrement W2557204736 · doi:10.1212/wnl.86.16_supplement.s32.004

Polychlorinated Biphenyls (PCBs) and Parkinson's Disease (PD): Effect Modification by Membrane Transporter Variants (S32.004)

2016· article· en· W2557204736 sur OpenAlexaff
Samuel M. Goldman, Freya Kamel, Monica Korell, Kathleen Comyns, David M. Umbach, Jane A. Hoppin, G. Webster Ross, Connie Marras, Meike Kasten, Anabel Chade, Aaron Blair, Caroline M. Tanner

Notice bibliographique

RevueNeurology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCarcinogens and Genotoxicity Assessment
Établissements canadiensToronto Western Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésParkinson's diseaseTransporterChemistryInternal medicineDiseaseMedicineEndocrinologyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective: Determine associations of PD with PCBs and investigate modification by variants in the xenobiotic-efflux membrane transporter p-glycoprotein gene (ABCB1, p-gp, MDR1) Background: PCBs have been inconsistently associated with PD risk. We recently reported significantly increased risk associated with higher serum PCBs in an Alaska Native population and much stronger associations in persons with ABCB1 variants. Here we investigate those associations in another population. Methods: We recruited people with PD (PwPD) and matched controls from the Agricultural Health Study cohort of pesticide applicators and their spouses. PD was confirmed by expert consensus. We genotyped ABCB1 single nucleotide polymorphisms (SNPs) using an Illumina custom array, and measured 15 PCB-congeners in serum using GC-MS. We adjusted for total lipid and used β-substitution to impute undetectable values, and also analyzed summed levels of PCB-118, 138, 153 and 180 (PCB_sum). We assessed associations with PD using logistic regression adjusting for age, gender and state, and examined multiplicative interactions of PCBs and SNPs. Results: Analyses included 97 PwPD and 113 controls. All PCBs were higher in PwPD. For PCB_Sum, compared with the lowest quartile (Q1), odds ratios for Q2, Q3 and Q4 were 1.7, 2.5 and 2.7, respectively (p-trend 0.02). ABCB1 coding variant rs9282564 modified PD-PCB associations: relative to those with below-median PCB_sum, above-median PCB_sum was associated with 1.4-fold (95[percnt]CI 0.7-2.8) greater risk in those with AA genotype, but 11.4-fold (95[percnt]CI 2.8-45) greater risk in those with AG or GG genotype (p-interaction 0.008). Conclusions: In this primarily Caucasian population, as in the Alaska Native population, PCB levels were higher in PwPD than controls. Risk was markedly increased in persons with both above median PCB levels and variants in ABCB1, suggesting a gene-environment interaction. Study Supported by: NIEHS-R01-ES10803, NIH Intramural Research Program (NIEHS-Z01-ES044007, Z01-ES049030; NCI-Z01-CP010119), Michael J. Fox Foundation, James and Sharron Clark.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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