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Enregistrement W2557466934 · doi:10.1182/blood.v116.21.94.94

Enriched MicroRNA-126 Bioactivity Marks the Primitive Compartment In AML and Regulates LSC Numbers

2010· article· en· W2557466934 sur OpenAlexaff
Eric R. Lechman, Bernhard Gentner, Hidefumi Hiramatsu, Kristin J. Hope, Katsuto Takenaka, Kolja Eppert, Mark D. Minden, Luigi Naldini, John E. Dick

Notice bibliographique

RevueBlood · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversité de MontréalInstitute for Research in Immunology and CancerUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésmicroRNAGene knockdownBiologyMyeloid leukemiaLeukemiaCancer researchStem cellGene expression profilingPopulationHaematopoiesisCell cultureMolecular biologyImmunologyGene expressionCell biologyGeneMedicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Abstract 94 Previous work has shown miRNAs to be dysregulated in acute myeloid leukemia (AML), however, there is little known regarding miRNA expression and function in leukemia stem cells (LSC). In order to elucidate the role of miRNA in LSC, we performed miRNA profiling on fractionated subpopulations of primary AML patient samples. Supervised analysis guided by the in vivo SCID leukemia initiating capacity (SL-IC) of each sub-population generated a unique miRNA signature associated with LSC enriched fractions. An in vitro antagomir-based functional miRNA knockdown screen identified miR-126, our top array candidate, for further study. After RT-PCR validation, the biological activity of miR-126 was confirmed at single cell resolution by using a novel bidirectional lentivirus miRNA reporter system in the 8227 cell line in vitro and within primary AML patient samples xenografted into immune-deficient NSG mice. These data suggest that primitive AML cells may express high levels of bioactive miR-126 relative to more “differentiated” blast populations. To test the hypothesis that AML stem cells are marked by high miR-126 bioactivity, we FACS sorted miR-126 genetic reporter vector transduced primary AML patient samples and transplanted these populations into immune-compromised secondary mouse recipients. The results of these proof-of-concept experiments demonstrates our ability to prospectively isolate LSC enriched fractions in all 4 AML patient samples tested using only a single biomarker, miR-126. Finally, to understand the functional relevance of miR-126 expression within primitive AML cells, stable enforced expression and knockdown of miR-126 was achieved using lentiviral vectors. Enforced expression of miR-126 in CD34+CD38- 8227 cells resulted in reduced AML blast colony formation, an increase/maintenance of CD34+ cells and a decrease in differentiation marker positive (CD14, CD15) AML blasts. Similarly, enforced miR-126 expression in 4 primary AML xenografts resulted in a several fold increase of CD34+CD117+ lentivirus marked leukemia cells after 12 weeks. In addition, the miR-126 cells showed reduced differentiation marker expression (CD14, CD15) with no significant differences in AML graft size. To determine if the expanded population had SL-IC activity or was a downstream leukemic progenitor, limiting dilution assays were performed by transplantation of FACS sorted lentivirus marked cells into secondary recipient mice for 12 weeks. A 13 fold increase in LSC activity was observed with miR-126 forced expression compared to control vector expressing cells. These data suggest that high levels of miR-126 bioactivity may support self-renewal/maintenance of primitive AML cells at the cost of aberrant differentiation. Conversely, in vitro knockdown of miR-126 in CD34+CD38- 8227 cells increased AML blast colony formation, while no phenotype was observed in xenotransplanted primary AML, with secondary LDA transplant experiments ongoing. Target prediction algorithms and previously described target genes were used to ascertain the principal signaling pathway(s) under direct control of miR-126 in primitive AML cells. In summary, these experiments demonstrate that miR-126 is more abundantly expressed and biologically active within the leukemia stem/progenitor cell compartment of the AML functional hierarchy and serves to regulate AML stem cell numbers. Disclosures: No relevant conflicts of interest to declare.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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