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Enregistrement W2557486921 · doi:10.1107/s2053273314095588

Mycobacterial Trehalose Synthase as a potential drug target for tuberculosis

2014· article· en· W2557486921 sur OpenAlexaff
S. Caner, Nham T. Nguyen, A.H. Aguda, Ran Zhang, Yuan Pan, Stephen G. Withers, Gary D. Brayer

Notice bibliographique

RevueActa Crystallographica Section A Foundations and Advances · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLegume Nitrogen Fixing Symbiosis
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTrehaloseBiochemistryActive siteMaltoseDisaccharideEnzymeATP synthaseChemistryGlycogen synthaseGlycogen branching enzymeGlycogenBiosynthesisBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Trehalose synthase (TreS) catalyzes the reversible conversion of maltose to trehalose in mycobacteria as one of three biosynthetic pathways to this non-reducing disaccharide. Given the importance of trehalose to survival of mycobacteria there has been considerable interest in understanding the enzymes involved in its production; indeed the structures of the key enzymes in the other two pathways have already been determined. Herein we present the first structure of TreS from Mycobacterium smegmatis, thereby providing insights into the catalytic machinery involved in this intriguing intramolecular reaction. This structure, which is of interest both mechanistically and as a potential pharmaceutical target, reveals a narrow and enclosed active site cleft within which the intramolecular rearrangement can occur with minimal hydrolysis. We also present the structure of a complex of TreS with acarbose, revealing a hitherto unsuspected oligosaccharide binding site within the C-terminal domain. This may well provide an anchor point for the association of TreS with glycogen, thereby enhancing its role in glycogen biosynthesis and degradation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,969
Score d'incertitude au seuil0,604

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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