Complete mitochondrial genomes of <i>Callospermophilus lateralis</i> and <i>Urocitellus richardsonii</i> (Rodentia: Sciuridae)
Notice bibliographique
Résumé
The complete mitochondrial genomes of Callospermophilus lateralis and Urocitellus richardsonii (Rodentia: Sciuridae) were sequenced to analyze the gene arrangement and discuss the phylogenetic relationship of species within the Xerinae. The genomes are circular molecules of 16,457 bp and 16,460 bp in length, respectively, including the 37 genes typically found in other squirrels. The AT content of the overall base composition is 63.2% for both species. The length of control region for C. lateralis is 1009 bp with 62.8% AT content; the corresponding values for U. richardsonii are 1012 bp and 62.0% AT content. In BI and ML phylogenetic trees, the monophyly of the family Sciuridae and subfamilies Callosciurinae and Sciurinae are well supported, but the monophyly of Xerinae is not supported. Within the Xerinae, the relationship of (Tamias sibiricus + (Callospermophilus lateralis + (Marmota himalayana + (Urocitellus richardsonii + (Ictidomys tridecemlineatus + (Cynomys leucurus + Cynomys ludovicianus)))))) is well supported. However, Tamiops swinhoei (Xerinae) within the subfamily Callosciurinae is a clade sister to Dremomys rufigenis (Callosciurinae). Spermophilus dauricus (Xerinae) within subfamily Sciurinae is a sister clade to Sciurus vulgaris (Sciurinae). The monophyly of Xerinae is failed to support in this study.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».