Mail-In Crystallography at the Canadian Light Source
Notice bibliographique
Résumé
The Canadian Macromolecular Crystallography Facility (CMCF) operates two crystallography beamlines, 08ID-1 and 08B1-1 (http://cmcf.lightsource.ca), at the Canadian Light Source (CLS). Normal access is through a traditional peer review process but commercial access is also welcome. Users apply for beamtime against their active proposals and may collect data in person or via remote access (Remote Control or Mail-In). Remote Control allows users to control the beamlines remotely from home institutions. Additionally, users with the highest peer review scores have the option of Mail-In beamtime, where data are collected by CMCF staff according to investigators' instructions. This method has proven very effective for several reasons. Data are collected by trained personnel experienced with the beamlines, resulting in high quality data. Travel expenses are eliminated. Data are collected around regular user shifts using the most appropriate beamline, reducing wasted beamtime and providing flexibility. The process is made extremely efficient when integrated with MxLIVE, the CMCF Laboratory Information Management System, since images can be viewed and output files downloaded almost immediately after data have been collected for the user. Four Mail-In shifts per week are typically supported during normal operations. In 2013 alone, over 430 datasets were collected for more than 20 investigators across Canada. At least 12 peer-reviewed articles appeared in 2013 containing Mail-In data, many in high-impact journals. Several of these results will be discussed.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,005 | 0,008 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,003 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,008 |
| Études des sciences et des technologies | 0,007 | 0,001 |
| Communication savante | 0,005 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,004 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,004 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,242 | 0,086 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».