Insights into minor pseudopilin complexes of the Type II secretion system
Notice bibliographique
Résumé
The type II secretion system (T2SS) is sophisticated multiprotein machinery that enables Gram-negative pathogens to secrete a wide range of exoproteins, named virulence factors, into the extracellular environments. In Pseudomonas aeruginosa, the Xcp T2SS is responsible for secreting many virulence factors that induce severe infections. In T2SS, the recognition and binding of secreted exoproteins are conducted by a structure called the pseudopilius tip, which is formed by four minor pseudopilins, including XcpU, XcpV, XcpW and XcpX. These minor pseudopilins form a quaternary complex, which is also involved in the initiation and regulation of the pseudopilus assembly. Although individual structures of these four pseudopilins have been revealed in different organisms, the substrate recognition and binding mechanisms have not been clearly elucidated due to the lack of systematic studies on the whole structures of several complexes formed by these pseudopilins. As a result, the understanding of the structures of these protein complexes will provide useful information for unveiling the mystery of the recognition and binding mechanisms. The establishment of the substrate binding model requires the preparation of stable complex(es) of substrates and certain minor pseudopilin(s). In this work, we aim to gradually elucidate the secretion mechanisms by assembling each component to build up the whole architecture. The structure of XcpV in complex with XcpW has been determined, and other complexes, especially the XcpU-containing binary and ternary complexes, have been stably established and purified. The identification of these complex structures will significantly promote our understandings of the type II secretion mechanisms.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».