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Enregistrement W2557663861 · doi:10.1002/cbic.201600546

Active Site Crowding of Cytochrome P450 3A4 as a Strategy To Alter Its Selectivity

2016· article· en· W2557663861 sur OpenAlexaff
Paolo Schiavini, Kin Jack Cheong, Nicolas Moitessier, Karine Auclair

Notice bibliographique

RevueChemBioChem · 2016
Typearticle
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiquePharmacogenetics and Drug Metabolism
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSteric effectsChemistryActive siteSelectivityHydroxylationCytochrome P450StereochemistryStereoselectivitySubstrate (aquarium)Protein engineeringCombinatorial chemistryRational designSteroidEnzymeBiochemistryCatalysisBiologyHormone

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Substrate-promiscuous enzymes are a promising starting point for the development of versatile biocatalysts. In this study, human cytochrome P450 3A4, known for its ability to metabolise hundreds of drugs, was engineered to alter its regio- and stereoselectivity. Rational mutagenesis was used to introduce steric hindrance in a specific manner in the large active site of P450 3A4 and to favour oxidation at a more sterically accessible position on the substrate. Hydroxylation of a synthetic precursor of (R)-lisofylline, a compound under investigation for its anti-inflammatory properties, was chosen as a first proof-of-principle application of our protein engineering strategy. In a second example, increasing active site crowding led to an incremental shift in the selectivity of oxidation from an internal double bond to a terminal phenyl group in a derivative of theobromine. The same correlation between crowding and selectivity was found in a final case focused on the hydroxylation of the steroid sex hormone progesterone.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,028
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,104
Tête enseignante GPT0,447
Écart entre enseignants0,343 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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