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Enregistrement W2557814534 · doi:10.1107/s2053273314089335

Two dimensional crystallization of calcium transport regulatory complexes

2014· article· en· W2557814534 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueActa Crystallographica Section A Foundations and Advances · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhospholambanSERCAEndoplasmic reticulumBiophysicsChemistryPentamerCrystallographyBiochemistryBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Phospholamban and sarcolipin physically interact with the sarcoplasmic reticulum calcium pump (SERCA) and differentially regulate contractility in smooth, skeletal, and cardiac muscle. While mutagenesis and cross-linking studies have provided insight into the mechanism of interaction, we lack a molecular understanding of these regulatory complexes. We have compared two crystal forms of SERCA in the absence and presence of phospholamban by electron cryo-microscopy. Our previous studies with phospholamban utilized both small helical crystals [1] and large two-dimensional crystals [2], where the fundamental units of both crystal forms were found to be anti-parallel dimer ribbons of SERCA molecules. The SERCA dimer ribbons have been known for decades as a rigid assembly of calcium-free SERCA molecules induced by the addition of decavanadate. While the lattice formed by the SERCA dimer ribbons is different in the helical (p2) and two-dimensional crystals (p22121), we now show that a phospholamban oligomer interacts with SERCA in a similar manner in both crystal types. With this information, we next undertook a structural investigation of SERCA and sarcolipin in the large two-dimensional crystals. Both wild-type and a gain-of-function mutant (Asn4-to-Ala) mutant of sarcolipin were utilized. Projection maps were determined for SERCA in the presence of sarcolipin to a resolution of 8.5 Å and were most consistent with a pentameric state for sarcolipin. While both phospholamban and sarcolipin interacted with transmembrane segment M3 of SERCA, the interaction of the sarcolipin pentamer was mediated by an additional density consistent with a sarcolipin monomer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,971
Score d'incertitude au seuil0,497

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle