Cellular and Biochemical Properties of Cell-Free DNA: A Prognostic Marker In Severe Sepsis Patients
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Abstract 2169 Background: Sepsis is the leading cause of morbidity and mortality in patients in the non-coronary ICU. However, the heterogeneity of patients with severe sepsis makes the identification of high-risk patients (ie. those who are sickest and thus would require more aggressive and expensive therapies) an ongoing challenge. Previously, we have shown that high levels of cell-free DNA (cfDNA) appear to be a powerful predictor of death in severe sepsis patients. Using Receiver Operating Characteristic curves, we have demonstrated that the area under the curve for cfDNA is 0.96 (95% CI=0.93–1.00). The purpose of this study is to characterize the source and biochemical properties of cfDNA in sepsis. Methods: Toll-like receptor (TLR) cells (which are stimulated by microbial-specific, unmethylated DNA) were used to determine whether the cfDNA found in septic patients is host- or microbe-derived. Whole blood, monocytes, and neutrophils were isolated from healthy volunteers and stimulated with either lipoteichoic acid and peptidoglycan (from Gram-positive bacteria) or lipopolysaccharide (LPS) from Gram-negative bacteria. Monocytes and neutrophils were also incubated with LPS-induced apoptosis inhibitors, cilostamide and cilostazol, prior to stimulation with LPS. DNAse enzymatic activity was quantified using Org 590 DNAse activity ELISA (Orgentec Diagnostica, GmbH), while DNAse protein was quantified by Western blot analyses. Results: Exposure of TLR9-reporter cells to cfDNA from sepsis patients revealed that the cfDNA is host-derived. Stimulation of whole blood, monocytes, neutrophils, and endothelial cells to microbial cell wall components revealed that monocytes and neutrophils are the major sources of cfDNA in sepsis. Of the total amount of nuclear DNA present within monocytes and neutrophils, nearly all was released into the supernatant upon stimulation. Inhibition of LPS-induced apoptosis with cilostamide and cilostazol did not completely prevent the release of cfDNA from monocytes and neutrophils. We also found that cfDNA levels correlated with levels of histones in septic patients and that the cfDNA was degraded to nucleosomal units. Finally, we observed an inverse correlation between levels of DNAse activity/DNAse protein and levels of cfDNA. Conclusions: These studies are the first to characterize the source and biochemical properties of cfDNA in sepsis. A portion of cfDNA release from monocytes and neutrophils appears to occur via an apoptosis-independent mechanism. Plasma levels of DNAse enzyme were reduced in septic patients compared to healthy volunteers. Disclosures: No relevant conflicts of interest to declare.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».