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Enregistrement W2558171111 · doi:10.1093/ofid/ofw194.42

Seroepidemiology of Invasive Pneumococcal Disease in Patients With Chronic Obstuctive Pulmonary Disease (COPD), Toronto, Canada

2016· article· en· W2558171111 sur OpenAlexaffabout
Wallis Rudnick, Allison McGeer, Karen Green, Jeff Li, Sylvia Pong-Porter, Agron Plevneshi, Jeffrey C. Kwong

Notice bibliographique

RevueOpen Forum Infectious Diseases · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePleural and Pulmonary Diseases
Établissements canadiensInstitute for Clinical Evaluative SciencesMount Sinai HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicinePneumococcal diseaseCOPDPulmonary diseaseDiseaseIntensive care medicineImmunologyInternal medicineStreptococcus pneumoniaeMicrobiologyAntibiotics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background. COPD is the 4th leading cause of death in the United States. Patients with COPD are one potential population for new pneumococcal vaccines. We reviewed population-based surveillance data in Toronto, Canada, to assess the burden of illness due to invasive pneumococcal disease (IPD) in persons with COPD. Methods. We report data from population-based surveillance for IPD in Toronto/Peel region since 1995. Cases are reported to a central study laboratory; antibiotic susceptibility and serotyping are performed. Patient information is collected by interview and chart review. Vaccine efficacy (VE) was estimated by the indirect cohort method. Results. A total of 1269/8641 (14.7%) adults IPD cases had underlying COPD. The average annual incidence of IPD in COPD patients from 2004 to 2015 was 6.0/100,000 for those aged 15–49 years, 12.7/100,000 for those aged 50–64 years, and 27.5/100,000 in those aged 65+. Median age was 74 years (range 31–103 years; 72% age ≥ 65). Among cases with available data, 620/859 (72%) had received influenza vaccine in the previous fall, 398/832 (48%) had received pneumococcal polysaccharide vaccine (PPSV), and 359/937 (38%) were current smokers. There were1073 cases of pneumonia (33 with empyema), 113 primary bacteremia, 21 meningitis, 54 other diagnoses. Four hundred eighteen (33%) required ICU admission, (28%) died during the hospitalization. The median length of stay (LOS) was 9 days (mean 19, IQR 4–19). VE for PPSV was 32% (95% CL 5%–50%). The case fatality decreased over time (205/666, 31% 1995–2005 versus 145/454 2006–2015, P < .001), ICU admission increased (199/660, 3% versus 219/602, 36%, P = .02) and LOS did not change. Incidence over time by serotype category is shown in Figure 1: herd immunity has substantially reduced disease due to PCV7 serotypes. The distribution of serotypes is different in patients with and without underlying COPD (Figure 2). In 2014/15, in patients with COPD, serotypes included in PCV7 caused 5.3% of disease, compared to 37.8% caused by additional PCV13 serotype, 22% by PPSV/non-PCV serotypes, and 35% by non-vaccine types. Conclusion. Despite the benefits of PPV23 in individual adults, herd immunity associated with pediatric PCV programs and declining case fatality, IPD burden in COPD patients is substantial. Use of PCV13, and new vaccines are needed to reduce this burden. Disclosures. A. McGeer, Pfizer Canada: Grant Investigator and Scientific Advisor, Grant recipient

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,134

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0020,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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