Seroepidemiology of Invasive Pneumococcal Disease in Patients With Chronic Obstuctive Pulmonary Disease (COPD), Toronto, Canada
Notice bibliographique
Résumé
Background. COPD is the 4th leading cause of death in the United States. Patients with COPD are one potential population for new pneumococcal vaccines. We reviewed population-based surveillance data in Toronto, Canada, to assess the burden of illness due to invasive pneumococcal disease (IPD) in persons with COPD. Methods. We report data from population-based surveillance for IPD in Toronto/Peel region since 1995. Cases are reported to a central study laboratory; antibiotic susceptibility and serotyping are performed. Patient information is collected by interview and chart review. Vaccine efficacy (VE) was estimated by the indirect cohort method. Results. A total of 1269/8641 (14.7%) adults IPD cases had underlying COPD. The average annual incidence of IPD in COPD patients from 2004 to 2015 was 6.0/100,000 for those aged 15–49 years, 12.7/100,000 for those aged 50–64 years, and 27.5/100,000 in those aged 65+. Median age was 74 years (range 31–103 years; 72% age ≥ 65). Among cases with available data, 620/859 (72%) had received influenza vaccine in the previous fall, 398/832 (48%) had received pneumococcal polysaccharide vaccine (PPSV), and 359/937 (38%) were current smokers. There were1073 cases of pneumonia (33 with empyema), 113 primary bacteremia, 21 meningitis, 54 other diagnoses. Four hundred eighteen (33%) required ICU admission, (28%) died during the hospitalization. The median length of stay (LOS) was 9 days (mean 19, IQR 4–19). VE for PPSV was 32% (95% CL 5%–50%). The case fatality decreased over time (205/666, 31% 1995–2005 versus 145/454 2006–2015, P < .001), ICU admission increased (199/660, 3% versus 219/602, 36%, P = .02) and LOS did not change. Incidence over time by serotype category is shown in Figure 1: herd immunity has substantially reduced disease due to PCV7 serotypes. The distribution of serotypes is different in patients with and without underlying COPD (Figure 2). In 2014/15, in patients with COPD, serotypes included in PCV7 caused 5.3% of disease, compared to 37.8% caused by additional PCV13 serotype, 22% by PPSV/non-PCV serotypes, and 35% by non-vaccine types. Conclusion. Despite the benefits of PPV23 in individual adults, herd immunity associated with pediatric PCV programs and declining case fatality, IPD burden in COPD patients is substantial. Use of PCV13, and new vaccines are needed to reduce this burden. Disclosures. A. McGeer, Pfizer Canada: Grant Investigator and Scientific Advisor, Grant recipient
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».