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Enregistrement W2558257534 · doi:10.1107/s2053273314091918

Structural studies on 14-3-3ζ: Compounds that target the dimer interface

2014· article· en· W2558257534 sur OpenAlexaff
Urmi Dhagat, Joanna M. Woodcock, Chrystal F. Tiong, Jessica K. Holien, Carl Coolen, Sophie E. Broughton, Stuart M. Pitson, Tim Hughes, Ángel Alfonso López, Michael Parker

Notice bibliographique

RevueActa Crystallographica Section A Foundations and Advances · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
Thématique14-3-3 protein interactions
Établissements canadiensDiscovery Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDimerSmall moleculeApoptosisCell biologyCancer cellSerineChemistryBcl-2 familyMutagenesisBiologyBiochemistryMutationCancerProgrammed cell deathPhosphorylationGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

14-3-3 proteins are a highly conserved family of dimeric phospho-serine binding proteins that modulate the functions of key cellular proteins involved in signaling. 14-3-3ζ plays a prominent role in signaling pathways leading to inhibition of apoptosis, sequestration of tumor suppressor proteins and activation of signalling pathways that promote growth. 14-3-3ζ expression is up-regulated in many human cancers and associated with enhanced survival of cancer cells. The significant association of 14-3-3ζ over expression with disease recurrence and chemo-resistance makes this protein an attractive candidate for anti-cancer therapy. The anti-apoptotic activity of 14-3-3ζ is entirely dependent on the dimeric state of the protein. Our studies have shown that 14-3-3ζ activity is regulated by sphingosine and other lipid analogs that render 14-3-3 phosphorylatable, disrupting its dimeric state thereby leading to apoptosis [1]. Structural studies and mutagenesis on 14-3-3ζ confirm that the dimeric state of 14-3-3ζ is stabilized by salt bridges that form across the dimer interface. Based on this we have carried out an in silico screen of a virtual library of drug-like small molecules to identify compounds that bind to the dimer interface of 14-3-3ζ. Candidate small molecules have been assessed for their ability to render 14-3-3ζ phosphorylatable in vitro and consequently we have identified a family of small molecules with 14-3-3ζ dimer-destabilizing properties. These small molecules induce apoptosis in leukemic cells by activating apoptotic mediators known to be regulated by dimeric 14-3-3. We have recently solved the crystal structure of 14-3-3ζ with one of our hit compounds bound at the dimer interface. Our results suggest that relatively small perturbations at the dimer interface, can destabilize the salt bridges that hold 14-3-3 dimers together, thus providing a novel approach to targeting 14-3-3 proteins for therapeutic benefit.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,974
Score d'incertitude au seuil0,563

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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