Towards the structure of an unusual nonribosomal peptide synthetase
Notice bibliographique
Résumé
Cereulide synthetase (Ces) is a macromolecular machine that produces a toxin involved in severe and lethal food poisoning. Ces belongs to the nonribosomal peptide synthetase (NRPS) family protein, and as such, it employs an assembly line mechanism to generate its cereulide product. The assembly line for cereulide differs from the canonical NRPS pathway because it adds hydroxy acids instead of amino acids at half of the positions in the molecule. To achieve this, the megaenzyme selects alpha keto acids through specialized adenylation domains and then reduces them to hydroxy acids in embedded ketoreductase domains, before adding them to the growing depsipeptide. Several details on the structural features of this unusual NRPS remain unknown. Here we report a full biochemical characterization of this highly complex megaenzyme. We obtained the kinetic constants of each of its four adenylation domains and probed the side chain selectivity for its alpha keto acid – recognizing adenylation domains. Also, we report that the activating protein MbtH is not required for full activity of the assembly line. Finally, we show that each of the modules can be inhibited through mechanism-based inhibitors, which can restrain the conformational flexibility paving the way for structural studies by X-ray crystallography.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».