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Enregistrement W2558445058 · doi:10.1096/fasebj.20.5.a997-c

Isomer‐specific retinoic acid biosynthesis in HeLa cells expressing recombinant class I aldehyde dehydrogenases

2006· article· en· W2558445058 sur OpenAlexafffund
Pangala V. Bhat, Helen Brodeur, Samuel Chagnon, Maxime Parisotto, Sylvie Mader

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinal Development and Disorders
Établissements canadiensUniversité de MontréalUniversité du Québec à MontréalCentre Hospitalier Universitaire Sainte-Justine
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésAldehyde dehydrogenaseRetinoic acidBiochemistryEnzymeIn vivoRetinalChemistryDehydrogenaseRetinoidHeLaRecombinant DNABiologyIn vitroStereochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Retinal dehydrogenase type 1 (RALDH1) catalyzes the oxidation of all‐trans and 9‐cis retinal to the respective retinoic acids (RAs), whereas another member of the aldehyde dehydrogenase family, the phenobarbital‐induced aldehyde dehydrogenase (PB‐ALDH), is very poorly active. We have previously generated chimeras between these two enzymes that displayed selectivity for retinal isomers in crude bacterial extracts. Here, we have characterized the kinetic properties of the corresponding purified recombinant proteins, and demonstrate that these chimeras catalyze oxidation of retinal isomers with high efficiency and selectivity. To examine whether the selectivity of the recombinant enzymes is retained in vivo, we first assessed whether retinoid‐isomerizing activity is present in cultured eukaryotic cells. Our results demonstrate that the only RA isomers detected in RALDH1‐expressing or non‐expressing cells corresponded to the same steric conformation as the supplied retinoids, indicating a lack of measurable 9‐cis/all‐trans retinoid‐isomerizing activity. Finally, HeLa cells transfected with RALDH1 derivatives that were retinal isomer‐selective in vitro produced only the corresponding isomers of RA in vivo, establishing these enzymes as useful tools to assess the respective roles of the two RA isomers in vivo. (supported by CIHR grant)

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,011
Score d'incertitude au seuil0,581

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,206
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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