Deciphering the activation of the E3 ubiquitin ligase parkin
Notice bibliographique
Résumé
Parkin is an E3 ubiquitin ligase responsible for some autosomal recessive forms of Parkinson's disease. Even though parkin is a RING-type E3 ligase, it uses a hybrid RING/HECT mechanism for its activity. The crystal structures of full-length and the RING0-RING1-In-Between-RING-RING2 module of parkin reveal a conformation of parkin in which its E2 binding site is too far from its catalytic cysteine for the transfer of ubiquitin [1]. Many intramolecular interactions occur between the different RING domains, as well as with a repressor element, which, with RING0, are unique to parkin. Mutations of residues involved in those interactions lead to an increase of parkin activity. This suggests that parkin adopts an auto-inhibited state in basal conditions. Therefore, under stress-response conditions, parkin needs to undergo molecular rearrangements, modulated by post-translational modification and/or interactions with other proteins, to become active. The phosphorylation of serine 65 in the Ubl domain of parkin by Pink1, a kinase also found mutated in some Parkinson's patient, was shown to increase the activity of parkin. Recent publications have demonstrated that ubiquitin is also phosphorylated by Pink1 and, furthermore, that phosphorylated ubiquitin could activate parkin [2,3]. We have used different techniques of structural biology and protein-protein interactions to further characterize the interaction of phosphorylated ubiquitin with parkin. This work provides insight into the mechanism of activation of parkin and that causes Parkinson's disease.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».