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Enregistrement W2558556205 · doi:10.1007/s11745-016-4217-y

Identification of Oxidized Phosphatidylinositols Present in OxLDL and Human Atherosclerotic Plaque

2016· article· en· W2558556205 sur OpenAlexafffund
Devin Hasanally, Andrea L. Edel, Amir Ravandi

Notice bibliographique

RevueLipids · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntioxidant Activity and Oxidative Stress
Établissements canadiensUniversity of ManitobaSt. Boniface Hospital
Organismes subventionnairesUniversity of ManitobaResearch ManitobaHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésChemistryPhosphatidylinositolIsoprostanesPhospholipidLipidologyBiochemistryLipoproteinFragmentation (computing)Clinical chemistryAntioxidantLipid peroxidationCholesterolSignal transductionBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Oxidized low-density lipoprotein (OxLDL) plays an important role in initiation and progression of atherosclerosis. Proatherogenic effects of OxLDL have been attributed to bioactive phospholipids generated during LDL oxidation. It is unknown what effect oxidation has on the phosphatidylinositol (PtdIns) molecules in LDL, even though PtdIns is 6% of the total LDL phospholipid pool. We sought to identify and quantitate oxidized phosphatidylinositol (OxPtdIns) species in OxLDL and human atherosclerotic plaque. Bovine liver PtdIns was subjected to non-enzymatic and lipoxygenase-catalyzed oxidation. Reversed-phase liquid chromatography with negative ESI-MS identified and confirmed compounds by fragmentation pattern analysis from which an OxPtdIns library was generated. Twenty-three OxPtdIns molecules were identified in copper-oxidized human LDL at 0, 6, 12, 24, 30, and 48 h, and in human atherosclerotic plaque. In OxLDL, OxPtdIns species containing aldehydes and carboxylates comprised 17.3 ± 0.1 and 0.9 ± 0.2%, respectively, of total OxPtdIns in OxLDL at 48 h. Hydroperoxides and isoprostanes at 24 h (68.5 ± 0.2 and 22.8 ± 0.2%) were significantly greater than 12 h (P < 0.01) without additional changes thereafter. Hydroxides decreased with increased oxidation achieving a minimum at 24 h (5.2 ± 0.3%). Human atherosclerotic plaques contained OxPtdIns species including aldehydes, carboxylates, hydroxides, hydroperoxides and isoprostanes, comprising 18.6 ± 4.7, 1.5 ± 0.7, 16.5 ± 7.4, 33.3 ± 1.1 and 30.2 ± 3.3% of total OxPtdIns compounds. This is the first identification of OxPtdIns molecules in human OxLDL and atherosclerotic plaque. With these novel molecules identified we can now investigate their potential role in atherosclerosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,374
Score d'incertitude au seuil0,241

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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