Truncated Human ATP-Specific Succinyl-CoA Synthetase
Notice bibliographique
Résumé
Two isoforms of the heterodimeric enzyme succinyl-CoA synthetase (SCS) exist in the mitochondria of humans. One is specific for ATP, while the other is specific for GTP. Both catalyze the reversible reaction: succinate + CoA + NTP ⇌ succinyl-CoA + NDP + Pi, where N denotes adenosine or guanosine. SCS is best known as an enzyme of the citric acid cycle where the reaction generates NTP. In the reverse direction, SCS replenishes succinyl-CoA required for the catabolism of ketone bodies and for heme synthesis. Nucleotide-specific forms are thought to be required for SCS to serve its different metabolic roles. The nucleotide specificity lies in the β-subunit [1], and the β-subunit of human ATP-specific SCS has been shown to interact with the C-terminus of erythroid-specific aminolevulinic acid synthase (ALAS2) [2]. ALAS2 catalyzes the committed step in heme synthesis: succinyl-CoA + Gly ⇌ 5-aminolevulinate + CoA + CO2. An interaction between SCS and ALAS2 makes biological sense, since this could provide channeling of succinyl-CoA from SCS to ALAS2. We hypothesize that the interaction is with the carboxy-terminus of the β-subunit of ATP-specific SCS because sequence comparisons show that the β-subunit of ATP-specific SCS has a carboxy-terminal extension when compared to other SCSs' β-subunits. To test this hypothesis, we added a carboxy-terminal His8-tag to the α-subunit of human ATP-specific SCS and mutated the codon for Thr 396β to a stop codon. This truncated version of human ATP-specific SCS has been produced in E. coli and purified. As well as testing to see if truncated human ATP-specific SCS interacts with ALAS2, we are using the truncated version in crystallization trials. Crystals of full-length human ATP-specific SCS diffract to only 3.2 Å and our goal is to obtain better-diffracting crystals of the complex of ATP with truncated human ATP-specific SCS.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».