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Enregistrement W2558744848 · doi:10.1111/mec.13946

The genetic architecture of tristyly and its breakdown to self‐fertilization

2016· article· en· W2558744848 sur OpenAlexafffund
Ramesh Arunkumar, Wei Wang, Stephen Wright, Spencer C. H. Barrett

Notice bibliographique

RevueMolecular Ecology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant and animal studies
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésSelfingBiologyGeneticsQuantitative trait locusLocus (genetics)Genetic architectureOutcrossingHeterostylyAlleleEvolutionary biologyPopulationGeneStamenPollenBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The floral polymorphism tristyly involves three style morphs with a reciprocal arrangement of stigma and anther heights governed by two diallelic loci (S and M). Tristyly functions to promote cross‐pollination, but modifications to stamen position commonly cause transitions to selfing. Here, we integrate whole‐genome sequencing and genetic mapping to investigate the genetic architecture of the M locus and the genetic basis of independent transitions to selfing in tristylous Eichhornia paniculata. We crossed independently derived semi‐homostylous selfing variants of the long‐ and mid‐styled morph fixed for alternate alleles at the M locus (ssmm and ssMM, respectively), and backcrossed the F1 to the parental ssmm genotype. We phenotyped and genotyped 462 backcross progeny using 1450 genotyping‐by‐sequencing (GBS) markers and performed composite interval mapping to identify quantitative trait loci (QTL) governing style‐length and anther‐height variation. A QTL associated with the primary style‐morph differences (style length and anther height) mapped to linkage group 5 and spanned ~13–27.5 Mbp of assembled sequence. Bulk segregant analysis identified 334 genes containing SNPs potentially linked to the M locus. The stamen modifications characterizing each selfing variant were governed by loci on different linkage groups. Our results provide an important step towards identifying the M locus and demonstrate that transitions to selfing have originated by independent sets of mating‐system modifier genes unlinked to the M locus, a pattern inconsistent with a recombinational origin of selfing variants at a putative supergene.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,181
Écart entre enseignants0,172 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2016
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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